我是使用 Vegan 进行生态系统级别分析的新手。
我有一个数据集，其中包含 10 个站点的 4,000 多个分类单元，另一个包含来自所有 10 个站点的 37 个基于化学的观察结果。
我已经使用 Vegan 包中的 prcomp 分析了两组数据，并使用 biplot(df) 绘制了结果，正如预期的那样，它对于化学数据看起来很棒，但是（如预期的那样）为分类数据产生了一个荒谬的不可读的图。
我在一个网站上读到，您可以根据驱动绘图的那些变量的加载值绘制双图 - 在他们的示例中，为了清楚起见，他们只绘制了 prcomp 结果中的前 10 个加载变量，但他们省略了显示如何他们做到了。（见http://www.pmc.ucsc.edu/~mclapham/Rtips/ordination.htm）
经过数小时的阅读和搜索如何根据加载（旋转）值进行绘图后，我找不到答案。谁能帮我弄清楚如何将我的变量缩小到最重要的变量而不是查看全部 4,000 个变量？
先感谢您。在一个