有谁知道一个完整的教程来学习编写 Python 或 TCL 脚本？我想编写一个脚本来加载一个分子，对其进行 3 种表示，并更改每个分子的属性（如着色方法、绘图方法、等值等），最后渲染图像。
我完成了本教程，但它教给脚本的只是加载一个分子并选择原子。 http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/vmd/tutorial-html/node4.html
是否有任何资源可以学习编写脚本来执行更高级的 vmd 操作？
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对于 Tcl 的一般学习，有Tcl 教程。对于 Python 的一般学习，有Python 教程（Python 2 版本）。您需要选择在那里使用的路线。然后，您将有足够的信息来查看VMD 文档并按照自己的方式进行操作，前提是您对如何解决问题有一点想象力。当您遇到一个特定的问题时，您可以在这里提问；Stack Overflow 是关于帮助解决特定问题的，而不是笼统的“我从哪里开始这个项目？！” 问题。
于 2015-03-09T09:22:46.467 回答
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一种可能性是您首先创建表示，更改属性等。然后，完成后，将状态保存到文件中（文件->保存可视化状态...）。以这种方式创建的文件是一个脚本，您可以使用普通文本编辑器对其进行编辑。例如，您可以搜索和替换您加载的分子文件的名称，以将相同的表示应用于其他分子。您还可以在脚本文件末尾添加渲染命令，例如：
render tachyon rendered_image.tga
编辑文件后，您可以通过 File->Load Visualization State 直接在 VMD 中加载它...或者您可以在启动 VMD 时加载它：
vmd -e your_edited_visualization_state_file.vmd
于 2016-06-30T15:05:25.973 回答