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如何在 Shiny 的 mainPanel 的结果选项卡上输出函数的结果（比如 caret 包中的混淆矩阵）？

这是我在 server.R 中的内容：

  #Create Confusion Matrix of Predictions
  ref = matrix(c("P", "N", "P", "P", "P", "P","N"), ncol=1)
  pred = matrix(c("P", "N", "N", "P", "P", "P","P"), ncol=1)
  output$confusionMat <- renderPrint({
    confusionMatrix(ref,pred)
  })

这就是我在 ui.R 中的内容：

 mainPanel(width = 4,
      tabsetPanel(
        #tabPanel("Plot", plotOutput("plot")),
        tabPanel("Result", selectInput("featureEx", "Feature Exploration",
                                       c("ABC", "AB", "AC", "A"), multiple = TRUE),
                          helpText("Prediction Results Using Testing data"),
                          dataTableOutput("confusionMat"),
                          capture.output("confusionMat"),
                          plotOutput("fePlot")
                         ),

当我在 RStudio 中输入函数时，得到的结果是：

> confusionMatrix(ref,pred)
Confusion Matrix and Statistics

          Reference
Prediction N P
         N 1 1
         P 1 4

               Accuracy : 0.7143          
                 95% CI : (0.2904, 0.9633)
    No Information Rate : 0.7143          
    P-Value [Acc > NIR] : 0.6792          

                  Kappa : 0.3             
 Mcnemar's Test P-Value : 1.0000          

            Sensitivity : 0.5000          
            Specificity : 0.8000          
         Pos Pred Value : 0.5000          
         Neg Pred Value : 0.8000          
             Prevalence : 0.2857          
         Detection Rate : 0.1429          
   Detection Prevalence : 0.2857          
      Balanced Accuracy : 0.6500          

       'Positive' Class : N

所以我想在一个格式很好的闪亮矩阵中显示混淆表，我希望能够使用 outputTable 来做到这一点，它不显示任何内容，并且在结果选项卡中也显示纯文本。目前主面板中没有显示任何内容。有什么解决办法吗？

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2 回答 2

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capture.output, from the base package, 加上textplotfrom PerformanceAnalyticspackage 你可能对这种情况感兴趣。

capture.outputconfusionMatrix允许您以文本格式分别从输出中提取每个元素。请注意，您可以根据需要重新排列输出，capture.output但在此特定示例中，我不会修改输出。然后你必须传递 to 的输出capture.output才能textplot将输出渲染为 Shiny 中的绘图。

在您上面提供的示例中，renderPrint我将使用renderPlot和利用上面提到的两个功能，如下所示：

require(PerformanceAnalytics)
output$confusionMat <- renderPlot({   #Replaced renderPrint with renderPlot
    textplot(      #wrap textplot around capture.output
        capture.output(     #capture output of confusionMatrix in text format
            confusionMatrix(ref,pred)  #your original code here
        )      #close capture.output
    )    #close textplot

}) #close renderPlot

但是，如果您真的想使用renderDataTable，则需要确保将数据框传递给renderDataTable.

这是一个具有不同数据集的完全可重现的示例。如果你运行下面的代码，结果会看起来很丑，那是因为我没有花时间重新安排capture.output我喜欢的输出。如果您想使用renderDataTable，您需要花一些时间来更改传递给的数据框的布局renderDataTable：

require(shiny)
require(caret)
require(PerformanceAnalytics)

server <- function(input,output,session){
    output$confusionMat <- renderDataTable({
        data.frame(
            capture.output(
                confusionMatrix(iris$Species, sample(iris$Species))
            )
        )

    })

}

ui <- shinyUI(fluidPage(

    sidebarLayout(
        sidebarPanel(

        ),

        mainPanel(
            dataTableOutput('confusionMat')
        )      

    )
))

shinyApp(ui = ui, server = server)
于 2015-03-04T05:23:36.770 回答
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我使用verbatimTextOutput("confusionmatrix")它并在 mainPanel 中显示了结果。

于 2015-03-04T05:47:30.613 回答