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我正在使用 R 通过 RESTful API 将图形对象 (igraph) 发送到 Cytoscape——效果很好。我遇到的问题是图形是动态的,每个节点/边缘都有一个创建/结束日期,是否可以在 Cytoscape 中进行动态可视化?我尝试过使用许多不同的插件,包括 dynNetwork,但是这会查找 XGMML 格式的网络文件。
有没有人遇到过 Cytoscape 插件来做这类工作?
或者失败了,是否有一个 R 包以 XGMML 格式输出 igraph 对象?
非常感谢。
我不了解 Cytoscape,但可以使用ndtvandnetworkDynamic包在 R 中可视化动态网络(免责声明,我是包作者)
ndtv
networkDynamic