我正在将基因组/gtf 数据转换为 FASTA 文件格式。我正在为此使用通量模拟器。通量模拟器的演示示例可以正常工作。之后,我从http://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.html、https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables?command=start下载了基因组和 gtf 数据。
但是在运行 mouse(mm9) gtf 时,它根本不起作用并显示错误:[ERROR] Error while loading stats: Field 5 not found java.lang.IllegalArgumentException: Field 5 not found
我还尝试为“fly”基因组运行通量模拟器。
我收到此错误:[INFO] Loading default PCR distribution Preparation transcript sequences ** 错误 [错误] 准备序列时出错:[错误] 分段时出错:读取序列 chr2L 时出现问题:pos 22877860,len 82,检查染色体序列是否存在/具有正确的大小 java.lang.RuntimeException: 读取序列 chr2L 时出现问题: pos 22877860, len 82,
你能告诉我如何解决这些问题吗?