python - 是否可以直接在 biom.Table 对象中获取轴的长度？

Question

是否可以直接在对象中查找轴的长度biom.Table，或者您是否需要执行以下操作，对象在t哪里Table：

if axis == 'sample':
    length = t.shape[0]
elif axis == 'observation':
    length = t.shape[1]
else:
   raise UnknownAxisError(axis)

似乎更好的方法是使用类似t.length(axis). 存在这样的功能吗？

Answer 1

目前最好的方法是：

>>> from biom import example_table
>>> axis = 'sample'
>>> print example_table.ids(axis).size
3

__len__当前没有重载，因为不清楚应该返回哪个轴。不过，拥有一个方法可能是有意义的length，如果您认为拥有它会更清晰，那么最好的下一步就是在 github项目上创建一个问题。