r - ggplot用geom_bar中的百分比替换计数

Question

我有一个数据框d：

> head(d,20)
   groupchange Symscore3
1            4         1
2            4         2
3            4         1
4            4         2
5            5         0
6            5         0
7            5         0
8            4         0
9            2         2
10           5         0
11           5         0
12           5         1
13           5         0
14           4         1
15           5         1
16           1         0
17           4         0
18           1         1
19           5         0
20           4         0

我正在密谋：

ggplot(d, aes(groupchange, y=..count../sum(..count..),  fill=Symscore3)) +
  geom_bar(position = "dodge") 

这样，每个条形代表其在整个数据中的百分比。

相反，我希望每个条形代表一个相对百分比；即获得的条的总和groupchange = k应该是1。

Answer 1

首先总结和转换你的数据：

library(dplyr)
d2 <- d %>% 
  group_by(groupchange, Symscore3) %>% 
  summarise(count = n()) %>% 
  mutate(perc = count/sum(count))

然后你可以绘制它：

ggplot(d2, aes(x = factor(groupchange), y = perc*100, fill = factor(Symscore3))) +
  geom_bar(stat="identity", width = 0.7) +
  labs(x = "Groupchange", y = "percent", fill = "Symscore") +
  theme_minimal(base_size = 14)

这给出了：

---

或者，您可以使用包中的percent功能scales：

brks <- c(0, 0.25, 0.5, 0.75, 1)

ggplot(d2, aes(x = factor(groupchange), y = perc, fill = factor(Symscore3))) +
  geom_bar(stat="identity", width = 0.7) +
  scale_y_continuous(breaks = brks, labels = scales::percent(brks)) +
  labs(x = "Groupchange", y = NULL, fill = "Symscore") +
  theme_minimal(base_size = 14)

这使：

Answer 2

如果您的目标是用最少的代码进行可视化，请position = "fill"在geom_bar().

如果你想在组百分比内，@Jaap 的dplyr答案是要走的路。

这是使用上述数据集复制/粘贴的可重现示例：

library(tidyverse)

d <- data_frame(groupchange = c(4,4,4,4,5,5,5,4,2,5,5,5,5,4,5,1,4,1,5,4),
                Symscore3 = c(1,2,1,2,0,0,0,0,2,0,0,1,0,1,1,0,0,1,1,0))

ggplot(d, aes(x = factor(groupchange), fill = factor(Symscore3))) +
  geom_bar(position="fill")

Answer 3

我们还可以为比例添加标签，而无需在源数据框中显式计算它们。

library(tidyverse)

d <- data_frame(groupchange = c(4,4,4,4,5,5,5,4,2,5,5,5,5,4,5,1,4,1,5,4),
                Symscore3 = c(1,2,1,2,0,0,0,0,2,0,0,1,0,1,1,0,0,1,1,0)) %>%
  mutate_all(as.character)  # treat the numbers as categories

ggplot(d, aes(x=groupchange, fill=Symscore3)) +
  geom_bar(position="fill") +
  geom_text(
    aes(label=signif(..count.. / tapply(..count.., ..x.., sum)[as.character(..x..)], digits=3)),
    stat="count",
    position=position_fill(vjust=0.5)) +
  labs(y="Proportion")

此解决方案中的geom_text标签改编自此处。