matlab - getblast错误不可用matlab

Question

我正在编写 matlab 代码，该代码应该遍历列表序列并一次爆炸。这是代码的相关部分：

%blast the seq

[res, ROTE] = blastncbi(seq, 'blastn');
res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE);
resName = res1.Hits(1).Name

对于某些 seq，它起作用了，然后最后它给了我这个错误消息：

Error using getblast (line 176)
BLAST V7EBUE0901R is unavailable - try later.

请注意，我已将 ROTE 定义为“WaitTime”值，正如该函数文档中所建议的那样。

脚本必须迭代很多很多基因，所以我不能让它每 5 分钟崩溃一次！

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RTOE返回的是blastncbi估计需要多长时间的时间。也许估计有时根本不正确。

处理这个问题的两种简单方法可能是等待更长时间，或者尝试两次：

res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE*10);

或者

try
   res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE);
catch
   res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE);
end

当然，这假设您确定您请求的信息确实可用。

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