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考虑一个文件,a.dat,其内容:

address 1, address 2, address 3, num1, num2, num3
address 1, address 2, address 3, 1.0, 2.0, 3
address 1, address 2, "address 3, address4", 1.0, 2.0, 3

我正在尝试使用numpy.genfromtxt. 但是,该函数在第 3 行中看到了一个附加列。我收到了类似的错误pandas.read_csv

np.genfromtxt('a.dat',delimiter=',',dtype=None,skiprows=1)

ValueError: Some errors were detected !
    Line #3 (got 7 columns instead of 6)

pandas read_csv sort of works - but it gives me an unaligned data structure:

pd.read_csv('a.dat')

pandas.parser.CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 6 fields in line 3, saw 7

我试图找到一个输入参数来弥补这一点。我不介意最终得到一个 numpy ndarray 或 pandas 数据框。

是否有我可以在其中设置genfromtxt和/或read_csv让我忽略语音标记中的逗号的参数?

我注意到它read_csv包括一个quotechar='"'参数,定义如下:

quotechar : string (length 1) 用于表示引用项的开始和结束的字符。引用的项目可以包含分隔符,它将被忽略。

这对我来说就像 read_csv 默认情况下应该适用于我的情况一样 - 但它没有。

我可以看到我可以预处理文件以去除逗号 - 如果可能的话,我想避免这种情况,但如果这是唯一的方法,我会欢迎提出建议。

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刚刚设法找到这个

我缺少的关键参数是skipinitialspace=True- 这“处理逗号分隔符后的空格”

a=pd.read_csv('a.dat',quotechar='"',skipinitialspace=True)

   address 1  address 2            address 3  num1  num2  num3
0  address 1  address 2            address 3     1     2     3
1  address 1  address 2  address 3, address4     1     2     3

这有效:-)

于 2014-06-06T10:24:20.910 回答
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Python 的内置csv模块可以处理这种数据。

with open("a.dat") as f:
    reader = csv.reader(f, skipinitialspace=True)
    header = next(reader)
    dtype = numpy.dtype(zip(header, ['S20', 'S20', 'S20', 'f8', 'f8', 'f8']))
    data = numpy.fromiter(itertools.imap(tuple, reader), dtype=dtype)
于 2014-06-06T10:21:52.397 回答