perl - 在 Ubuntu 12.04LS 中安装 bioperl

Question

我正在尝试在版本 5.20.0 的 Perl 环境中安装 Bioperl 包，但我无法进入这些东西。网站的想法和建议各不相同，这对我来说会很不安。请建议我在 Ubuntu 12.04LS 中安装 Bioperl 的协议。

Answer 1

来源： http: //www.bioperl.org/wiki/Installing_BioPerl_on_Ubuntu_Server

安装和配置基本 Ubuntu 服务器

安装然后配置。

apt-get clean
apt-get update
apt-get upgrade
apt-get install ssh screen
apt-get clean

尽可能使用 apt-get 安装

在 /etc/apt/sources.list 中启用 Universe 和 Multiverse

apt-get update
apt-get install \
 lynx unzip zip ncftp gcc libc6-dev make mysql-server apache2 \
 perl libgd-gd2-perl libcgi-session-perl libclass-base-perl libexpat1-dev
apt-get clean

安装不能通过 apt-get 获得的 CPAN 和 perl 模块

cpan -i 'Text::Shellwords'  # choose defaults if first time

安装 BioPerl

cd /tmp
wget -N http://bioperl.org/DIST/current_core_unstable.tar.bz2
tar -xjvf current_core_unstable.tar.bz2
cd bioperl-*
perl Build.PL   # choose the defaults
./Build test
./Build install