我有几列巨大的数据框:1)gridID 2)物种代码(SPCD)3)相关值(索引)4)相关值(索引1)和5)纬度。
但是 GridID 不是唯一的数字,因为 GridID 有多个 SPCD 例如,
tbl = data.frame(gridID=c(1,1,1,1,1,2,2,2,2,2),
SPCD=c(1,2,3,4,5,1,2,3,4,5),
INDEX=c(2,2,4,3,2,3,4,2,3,24),
INDEX1=c(1,4,3,5,4,2,34,6,4,3),
LAT=c(34.1,34.4,35,35.2,35.4,36,37,36.4,46,34))
我想通过 SPCD 找到 +/-0.5 纬度带组的移动平均线。
我所做的是
> #Generating a sequence of latitudinal bands
> lat_seq<-seq(from=26, to=49,by=.5)
> spcd_list<-unique(tbl$SPCD)
> # Creating a blank array to place the data in
> bands<-array(dim=c(length(lat_seq),nrow(spcd_list)+1,2))
> bands[,1,]<-lat_seq
>
> # Finding the averages for each moving latitudinal band
> for(i in 1:nrow(spcd_list)){
> for(j in 1:length(lat_seq)){
> lat_min<-lat_seq[j]-.5
> lat_max<-lat_seq[j]+.5
>
> #Defining the band width
> band<-subset(tbl,tbl$LAT>=lat_min & tbl$LAT<=lat_max)
>
> # Selecting the species of interest and
> # calculating average abundace measures
> species<-subset(band,band$SPCD==spcd_list[i,1])
>
> bands[j,i+1,1]<-mean(species$index)
> bands[j,i+1,2]<-mean(species$index1)
>
> } }
上述方法有效,但需要很多时间。我想知道是否有更好的方法来做到这一点。zoo 和 rollapply 是我正在学习的。但无法使其工作。