r - 在 Rnw 文件中混合 R 和 LaTeX 代码

Question

使用 knitr 将 .Rnw 文件转换为 .tex 文件时，我正在尝试将科学名称斜体化。运行时出现错误knit。这是我的 .Rnw 文件中包含的代码（运行需要taxize和stringr库）：

Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum \Sexpr{str_c("Collared Flycatchers (\\textit{", comm2sci(commnames='Collared Flycatcher', db="itis")[[1]], "})")[1]}

.tex 文件中的输出应该是：

Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum Collared Flycatchers (\textit{Ficedula semitorquata})

如何在 .tex 文件中获得此输出？

Answer 1

这对我有用

\documentclass{article}
\begin{document}
<<message=FALSE>>=
library("taxize")
@
Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum \textit{\Sexpr{comm2sci(commnames='Collared Flycatcher', db="itis")[[1]][2]}}
\end{document}

这会给你想要的吗？在我的输出 pdf 中看起来很正确。