imagej - 是否可以在 ImageJ 中进行“全景多维堆栈”？

Question

我正在做免疫组织化学，我有两个不同的信号，想做细胞计数。

我的想法是在二维（标记 1，标记 2）中使用 z 堆栈（20 帧）。这对我来说一张图片没有问题。但是，我正在查看的区域很大并且我想使用高放大倍率，所以我想将不同的图像组合成一个非常大的图像，这也是在两个标记中 z 堆叠的。

这可以做到吗，有什么提示吗？

编辑：另外，需要注意的是，我没有带电动载物台的共聚焦显微镜，只有没有机动载物台的常规落射荧光显微镜。

谢谢，普拉兹

Answer 1

只要您的图像包含大量重叠（不需要电动舞台，只需确保两个相邻图像在其边界处共享一些视觉特征），您就可以使用Fiji附带的Stitching插件：

• 插件 > 拼接 > 网格/集合拼接
• 在第一个对话框中，选择类型：未知位置

如果您的不同 z 级别和颜色通道位于单独的文件中，您可能必须先将它们组合成超堆栈（图像 > 颜色 > 合并通道...），然后再进行拼接。