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我一直无法从 topicmodels 的 LDA 函数中创建可重现的结果。从他们的文档中举一个例子:

library(topicmodels)
set.seed(0)
lda1 <- LDA(AssociatedPress[1:20, ], control=list(seed=0), k=2)
set.seed(0)
lda2 <- LDA(AssociatedPress[1:20, ], control=list(seed=0), k=2)
identical(lda1, lda2)
# [1] FALSE

如何从对 LDA 的两次单独调用中获得相同的结果?

顺便说一句(如果包作者在这里),我发现这个control=list(seed=0)片段很不幸并且没有必要。在幕后,有一条线if (missing(seed)) seed <- as.integer(Sys.time())。这不会使过程更可靠地随机化,它只会撤消指定的种子。我错过了什么吗?

更新:正如@hrbrmstr 在下面发现的那样,将种子作为控件传递会产生实际上相同的对象,唯一的区别是临时本地文件位置。所以这个问题更像是一个误解(尽管如果函数得到尊重,它似乎仍然会更清楚set.seed())。

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1 回答 1

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不是真正的“答案”,但没有其他方法可以发布代码片段:-)

我试了一下:

library(topicmodels)

data(AssociatedPress)

lda1 <- LDA(AssociatedPress[1:20, ], control=list(seed=0), k=2)
lda2 <- LDA(AssociatedPress[1:20, ], control=list(seed=0), k=2)

identical(lda1, lda2)
[1] FALSE

all.equal(lda1, lda2)
[1] "Attributes: < Component 5: Attributes: < Component 10: 1 string mismatch > >"

a1 <- posterior(lda1, AssociatedPress)
a2 <- posterior(lda2, AssociatedPress)

identical(a1, a2)
[1] TRUE

all.equal(a1, a2)
[1] TRUE

all.equal(lda1@alpha,lda2@alpha)
[1] TRUE
all.equal(lda1@call,lda2@call)
[1] TRUE
all.equal(lda1@Dim,lda2@Dim)
[1] TRUE
all.equal(lda1@control,lda2@control)
[1] "Attributes: < Component 10: 1 string mismatch >"
all.equal(lda1@k,lda2@k)
[1] TRUE
all.equal(lda1@terms,lda2@terms)
[1] TRUE
all.equal(lda1@documents,lda2@documents)
[1] TRUE
all.equal(lda1@beta,lda2@beta)
[1] TRUE
all.equal(lda1@gamma,lda2@gamma)
[1] TRUE
all.equal(lda1@wordassignments,lda2@wordassignments)
[1] TRUE
all.equal(lda1@loglikelihood,lda2@loglikelihood)
[1] TRUE
all.equal(lda1@iter,lda2@iter)
[1] TRUE
all.equal(lda1@logLiks,lda2@logLiks)
[1] TRUE
all.equal(lda1@n,lda2@n)
[1] TRUE

identical(lda1@alpha,lda2@alpha)
[1] TRUE
identical(lda1@call,lda2@call)
[1] TRUE
identical(lda1@Dim,lda2@Dim)
[1] TRUE
identical(lda1@control,lda2@control)
[1] FALSE
identical(lda1@k,lda2@k)
[1] TRUE
identical(lda1@terms,lda2@terms)
[1] TRUE
identical(lda1@documents,lda2@documents)
[1] TRUE
identical(lda1@beta,lda2@beta)
[1] TRUE
identical(lda1@gamma,lda2@gamma)
[1] TRUE
identical(lda1@wordassignments,lda2@wordassignments)
[1] TRUE
identical(lda1@loglikelihood,lda2@loglikelihood)
[1] TRUE
identical(lda1@iter,lda2@iter)
[1] TRUE
identical(lda1@logLiks,lda2@logLiks)
[1] TRUE
identical(lda1@n,lda2@n)
[1] TRUE

“不平等”@control重要吗?

于 2014-03-25T01:25:19.910 回答