r - 将 mongo 控制台或 RMongo 查询转换为 rmongodb

Question

我在使用 RMongo 时遇到问题，所以我正在尝试将我的工作转换为 rmongodb。从这里开始，我的查询在 mongo 控制台中如下所示：

db.final.find({},{"ids.myid":1,"org.name":1,"_id":0}).skip(0).limit(5000)

在 RMongo 中就像这样：

dbGetQueryForKeys(db,'final', '{}','{"ids.myid":1,"org.name":1,"_id":0}',skip=0,limit=5000)

（后者不返回值，但 Mongo 控制台确实有效。）

我对文档的理解是它在 rmongodb 中应该是这样的：

library(rmongodb)
mcon <- mongo.create(host="myurl:port",db="dbname")

fields = mongo.bson.buffer.create()
mongo.bson.buffer.append(fields, "ids.myid", 1L)
mongo.bson.buffer.append(fields, "org.name", 1L)
mongo.bson.buffer.append(fields, "_id", 0L)

cur <-  mongo.find(mcon,"final",fields=fields, limit=5000) # query takes the default null
df <- mongo.cursor.to.data.frame(cur)

但是，我得到：

data frame with 0 columns and 0 rows

我的原始查询到 rmongodb 的正确翻译是什么？

我知道我的连接是有效的，因为：

mongo.get.databases(mcon)

工作并显示正确的数据库。但是，我调用集合的方式似乎存在问题，因为

mongo.find.one(mcon,"final") 

正在返回 NULL。尽管db.final.findOne()工作正常！

Answer 1

我的缓冲区构造也有误。

fields = mongo.bson.buffer.create()
mongo.bson.buffer.append(fields, "ids.myid", 1L)
mongo.bson.buffer.append(fields, "org.name", 1L)
mongo.bson.buffer.append(fields, "_id", 0L)

本来应该

buf = mongo.bson.buffer.create()
mongo.bson.buffer.append(buf, "ids.myid", 1L)
mongo.bson.buffer.append(buf, "org.name", 1L)
mongo.bson.buffer.append(buf, "_id", 0L)
fields <- mongo.bson.from.buffer(buf)

通过文档。

Answer 2

您的集合的命名空间 (ns) 错误。您的数据库名称丢失。尝试这个：

cur <-  mongo.find(mcon,"dbname.final",fields=fields, limit=5000)

和

mongo.find.one(mcon,"dbname.final")