问题标签 [rmongodb]

我想从 R 获取 MongoDB 查询。

使用mongo外壳，我会查询：

但是，在 R-Mongo 中，我还没有找到如何描述这个查询。

谢谢

当使用rmongodb包并且最终对象应该是 a 时，您将如何处理MongoDB 查询的结果集（长度 > 1 ） ？list

我尝试避免在单list步执行结果集时简单地附加对象时发生的 R 典型的“按值传递”复制效率低下。但为了做到这一点，我想我需要知道查询总共返回了多少“记录”，不是吗？这样，我可以跨越一个空列表，并在单步执行结果集时将其填满——甚至更好，我可以使用lapply()等等。

这是一个小例子

示例内容

该示例取自MongoDB 网站并通过rmongodb实现

询问

处理查询结果

这是我能想到的最好的：

然而，我正在寻找的是类似as.list(cursor)或类似的东西：

这可能吗？不幸的是，我对我认为包使用的 C/C++ 指针并不十分熟悉。

由于 MySQL 让我发疯，我试图让自己熟悉我的第一个“NoSQL”DBMS，它恰好是MongoDB。我通过rmongodb连接到它。

我玩的越多rmongodb，关于运行高级查询的问题/问题就越多。

首先，在详细介绍我似乎无法正确指定的不同类型的查询之前，我先介绍一些示例数据。

示例数据

该示例取自MongoDB 网站，并进行了一些简化。

与插入 JSON/BSON 对象相关的两个问题：

1. 文档'test.posts'，字段voters：在这种情况下使用是否正确c()？
2. 文档'test.posts'，字段comments：指定这个的正确方法是什么，c()或者list()？

顶级查询：他们很享受

顶级查询工作得很好：

问题一：基本子级查询

如何运行需要进入JSON/BSON样式 MongoDB 对象的任意深度子级别的简单“子级别查询”（与顶级查询相反）？这些子级查询使用 MongoDB 的点表示法，我似乎无法弄清楚如何将其映射到有效的rmongodb查询

在简单的 MongoDB 语法中，类似于

会工作。但我不知道如何用rmongodb函数做到这一点

这是我到目前为止尝试过的

问题 2：使用$运算符的查询

这些工作

查询 1

查询 2

但是，请注意，原子集将导致返回值NULL

尝试与子级别查询相同，我又迷路了

我正在尝试使用rmongodb从 MongoDB 数据库中获取信息以在 R 中进行进一步处理。但是，我很难真正开始。这个有效：

现在，如果我想找到名字是“John”、“Bob”或“Catherine”的人怎么办？我试过query=list(last.name="Smith", first.name=c(John, Bob, Catherine))了，但这没有成功。替换也不起作用=。%

另一个问题是数据库内容是嵌套的，这意味着我有子树、子子树等。例如，对于条目，first.name="John", last.name="Smith"我可能有子条目address, age, occupation，如每年我都会有一个条目，如“失业”、“文员”、“企业家”）。那么，如果我想找到所有 40 岁且在 2010 年失业的名字为“John”的人怎么办？查询会是什么样子？

编辑作为对 Stennie 的回复：这是我的数据库结构和我正在尝试执行的查询的示例。想象一所大学的校友被细分为小组（例如“非常优秀的学生”、“优秀的学生”等）。然后，每个组都包含已分配到该组的人员列表及其详细信息。

现在让我们假设我对名为“最好的学生”和“好学生”的组感兴趣，并希望将每个组的每个成员的“姓氏”和“职业”作为 R 对象，以便做一些情节，统计数据或其他什么。也许我还想改进这个请求，只接收那些年龄小于 40 岁的成员。现在在阅读了 Stennie 的回复后，我这样尝试：

运行后没有错误消息，但我得到一个空数据框。这段代码有什么问题？

我正在努力在 R 和 rmongodb 中使用 $or 创建查询。我想效仿的是来自 cmdline mongo 的：

我想提取 person.cell 不为 null 或 person.home 不为 null 的记录。我可以单独查询每个，但是当我使用 $or 在 rmongodb 中创建缓冲区时无法取回数据，使用 rmongodb 的 R 代码如下所示：

这不会返回任何记录，没有错误，只是一个空集。正如我所提到的，我可以在 person.cell 或 person.home 上进行查找并获得结果，但当我尝试执行 $or（在 rmongodb 中）以便我使用 person.cell 或 person.home 提取记录时却不行.

我也试过这个：

但是我得到了相同的空集结果（当我查看它时，“b”看起来是一样的）。我坚持这个。

有没有人能够使用连接到 MongoDB 副本集rmongodb？无论我如何配置mongo.create，我都会收到身份验证错误，即使相同的主机/用户名/密码在通过mongoshell 连接时工作正常。

我的代码相当于：

更新：

查看副本集中所有节点的日志，当我运行上面的代码时，我没有看到任何身份验证尝试。因此，这可能是一个rmongodb错误。

我正在查询包含示例中显示的条目的数据库。所有条目都包含以下值：

• _idoverallitem:和的唯一标识placed_items
• name: 你的名字overallitem
• loc:overallitem和的位置placed_items
• time_id:overallitem存储时间
• placed_items：包含数组placed_items（范围可以从零：placed_items : [],到无限量。
• category_id: 的类别placed_items
• full_id: 的完整 idplaced_items

我想在给定和约束的每个级别上提取name,full_id和category_idplaced_itemstime_idloc

示例数据：

此示例的预期结果是：

因此，如果placed_items为空，请将条目放入数据框中，如果placed_items包含n条目，则将n条目放入数据框中

我试图制定一个 RBlogger 示例来创建所需的数据框。

如果我想在某个overallitem级别（即_idor name）提取值但无法收集placed_items级别上的信息，则条件有效并且代码有效。此外，提取的虚线调用full_id似乎category_id不起作用。任何人都可以帮忙吗？

我正在尝试在 MongoDB 集合上创建一个组查询，类似于：

我正在使用 rmongodb。通过查看 rmongodb 包文档，他们使用mongo.command来运行计数命令：

也不同：

有没有人成功使用mongo.command过进行组查询？

我正在尝试使用 R 进行 mapreduce。有一个名为 mapReduce 的 R 包，但它的功能不适用于复杂的 mapreduce 应用程序。我正在为我的数据库使用 mongodb 并使用 R 的 rmongodb 包来访问它。现在如果你需要做一些 mapredece，有人知道一个好的 R 包吗？

我正在使用 rmongodb 来获取特定集合中的每个文档。它可以工作，但我正在处理数百万个小文档，可能是 100M 或更多。我正在使用作者在网站上建议的方法：cnub.org/rmongodb.ashx

这适用于数百或数千个结果，但 while 循环非常非常慢。有什么方法可以加快速度吗？也许是多处理的机会？任何建议，将不胜感激。我平均每小时 100 万，按照这个速度，我需要一周的时间来构建数据框。

编辑：我注意到while循环中的向量越多，它变得越慢。我现在尝试为每个向量分别循环。虽然仍然看起来像一个黑客，但必须有更好的方法。

编辑 2：我对 data.table 很幸运。它仍在运行，但看起来它将在 4 小时内完成 12M（这是我当前的测试集），这是一个进步，但远非理想

}