我获得了许多不同的 GPS 轨迹,并试图使用 ggmap 将所有路径绘制到一张地图上。我正在尝试制作类似于Flowing Data所做的工作的东西,其中作者使用 plotkml 而不是 ggmap (我更喜欢)。不幸的是,在添加了几条路径后,我的 R 脚本显然由于内存过多而停止运行。有人可以帮忙吗?
我在 MacOS 上使用 R 版本 3.0.2。
这是一个功能齐全的脚本。我手动放入了三个示例数据帧,其中一帧来自 GPS 坐标的一个跟踪文件。实际上,我有超过4000 个这样的数据框。
library(ggmap)
printf <- function(...) cat(sprintf(...))
# ---------------------------------------------------------
# Create three example data frames
df1 <- structure(list(latitude = c(37.789165, 37.827332, 37.851501),
longitude = c(-122.411667, -122.210167, -122.265831)), .Names = c("latitude",
"longitude"), class = "data.frame", row.names = c(4634L, 5415L,
30777L))
df2 <- structure(list(latitude = c(37.331951, 37.332291), longitude = c(-122.029579,
-122.028625)), .Names = c("latitude", "longitude"), class = "data.frame", row.names = c(18781L,
18787L))
df3 <- structure(list(latitude = c(37.789333, 37.780834, 37.622833,
37.7775), longitude = c(-122.408669, -122.423668, -122.330666,
-122.43383)), .Names = c("latitude", "longitude"), class = "data.frame", row.names = c(44107L,
44182L, 44237L, 44277L))
allDataFrames <- list(df1, df2, df3)
numDataFrames <- length(allDataFrames)
# ---------------------------------------------------------
# Get the background map
map <-get_googlemap(center=c(lon=-122.237, lat=37.753),maptype="roadmap", color="bw", zoom=9)
p <- ggmap(map)
dfCounter <- 0
# Loop over all the data frames.
for (df in allDataFrames)
{
# Plot this data frame as a path.
p <- p + geom_path(aes(x=longitude, y=latitude), data=df, colour="#ff0000", size=0.5)
printf("%d / %d\n", dfCounter, numDataFrames)
dfCounter <- dfCounter+1
}
print(p)
现在,当循环完成第 300 次迭代时,脚本会停止,没有任何进展。我怀疑是这条线:
p <- p + geom_path(aes(x=longitude, y=latitude), data=df, colour="#ff0000", size=0.5)
但我不知道如何改进。我需要达到 4000 个数据帧,它已经停止在 300 个。
在我的 MacOS 上“top”的输出显示 RSIZE(物理内存)和 VSIZE(虚拟内存)已经脱钩。问题是什么?
在运行脚本之前:
PID COMMAND %CPU TIME #TH #WQ #POR #MREG RPRVT RSHRD RSIZE VPRVT VSIZE PGRP PPID STATE UID FAULTS
42708 R 0.0 00:00.18 1 0 21 126 30M 244K 34M 47M 2440M 42708 448 sleeping 501 9464
在运行脚本时,在迭代 150 左右:
PID COMMAND %CPU TIME #TH #WQ #POR #MREG RPRVT RSHRD RSIZE VPRVT VSIZE PGRP PPID STATE UID FAULTS
42708 R 100.1 00:45.87 1/1 0 22 544+ 2002M+ 244K 2018M+ 2034M+ 4429M+ 42708 448 running 501 773737+