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我的最终目标是制作一个融合热图和系统发育树的图。我已经完成了热图，我还在 BioPython 中找到了 ETE2 包，它可以帮助我合并两种图，但是 ETE2 需要 Newick 格式（树状）而不是距离矩阵（我有）作为输入。有谁知道 BioPython 中的一个模块可以帮助我做到这一点？

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在 Biostars 中似乎有一个关于它的线程。这指向了转换这些格式的答案，然后是对 ETE 邮件列表的讨论。

我在网上找到了这个转换器，我不确定它是否适合你。

要求找到一个工具是题外话，我刚刚做了一个谷歌研究......

于 2014-05-14T12:12:23.197 回答