0

我正在对 x 和 y 是空间坐标的大型空间数据集进行聚类分析。我正在使用 hclust 和 dynamicTreeCut，然后为了表示我使用 ggplot 显示散点图。

但我无法正确可视化集群，因为我只能在行或列中显示剪切。

这是我想要的玩具样本，但是对于我的数据，集群只能在水平方向工作（所以我认为它应该只对 y 进行集群或可视化）。

# x and y are coordinates of points in a map

x <- sample(1:1000, 80)
y <- sample(1:1000, 80)

df <- data.frame(x,y)

hc <- hclust(dist(df, "euclidean"),"complete");

maxCoreScatter <- 0.81
minGap <- (1 - maxCoreScatter) * 3/4
groups <- cutreeDynamic(hc, minClusterSize=1, method="hybrid", distM=as.matrix(dist(df)), deepSplit=4, maxCoreScatter=maxCoreScatter, minGap=minGap)
df$group <- groups

p <- ggplot(df, aes(x,y,colour=factor(groups))) + geom_point() + theme(aspect.ratio = 1)
p
4

0 回答 0