xml - 一次命中下多个 HSP 是什么意思？

Question

我是生物信息学领域的新手。我正在查看一个 BLAST xml 输出文件，并试图了解为什么每个爆炸命中下都有多个 HSP。我知道 HSP 代表 High-Scoring Segment Pair，但我真的不明白如何以及为什么将多个 HSP 分配给单个命中。

Answer 1

好的，所以我给你一个大致的想法。例如，对于序列 A 和序列 B，序列的多个部分可能是相同/相似或高分。更加具体：

序列A：#######AAAAAA????????ATCG///////////////////////// /

序列B：#######CCCCCC????????ATCG///////////////////////// /

因此，您将获得上述两个序列的三个结果。一个用于“#”部分，另一个用于“？” 部分，最后一个用于“/”部分。无论如何，我很高兴有更多的人质疑生物信息学相关的东西。

干杯!