database - 如何使用信息增益对基因进行排名？

Question

如何使用信息增益和卡方统计对微阵列数据进行基因排序？请用一个简单的例子来说明..

Answer 1

您可以使用开源机器学习软件Weka。加载您的数据集并转到“选择属性”选项卡。使用以下属性评估器：

ChiSquaredAttributeEval：通过计算关于类的卡方统计值来评估属性的价值。

InfoGainAttributeEval：通过测量关于类的信息增益来评估属性的价值。

..在“搜索方法”中使用排名器。这样，属性将按其各自的评估进行排名

Answer 2

您可以InfoGainAttributeEval 用于计算信息增益，有关更多信息，请查看此答案

Answer 3

我不完全理解你的问题，但可以在这里找到一个非常成功的分析微阵列数据的软件包：

生物导体

这是一个软件项目，具有各种不同的模块，用于从微阵列读取数据并执行统计分析。这非常有用，因为微阵列数据的文件格式随着技术的发展而不断变化，分析微阵列数据的算法也有了显着的进步。