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我正在寻找用于在显微镜图像中分类细胞类型的可靠特征。我想知道最好的方法是什么。

1) 我尝试了 Pontil & Verii 描述的方法——使用标准化图像的每个像素作为特征。它很容易实现,但结果并不完全令人满意。另一个问题是 - 分类是用某种统计魔法完成的,我不明白为什么有些结果不好。

2)我尝试提取高级特征,例如峰、孔。我的实现很慢,但优点是我理解为什么一个单元格被识别为这样而另一个不是,因为您可以在测试图像中可视化这些特征。

3)最近我在一篇文章中发现了这样的功能:

角二阶,距离,对比度,熵,反差距离,相关,和的平均值,差的平均值,和的熵,差的熵,方差,和的方差,差的方差。

我想知道是否有一些标准库可以提取这些特征(最好是 C/C++)?是否有包含优点/缺点、用例描述等的功能类型目录?

感谢您提前提出任何建议!

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我可以推荐Lindblad 等人的这篇文章,发表在科学杂志 Cytometry 上。它涵盖了细胞特征提取和分类的某些方面。它不使用任何标准库进行特征提取/分类,但它包含有关如何基于一般特征构建分类器的一些信息。

这可能无法完全解决您的问题,但我希望它可以帮助您找到更好的解决方案。

于 2013-11-15T14:56:47.120 回答
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您应该尝试 Gabor 特征提取技术,因为它应该提取与人类视觉皮层细胞非常相似的特征……通过在不同的方向和比例设置过滤器,然后从每个设置中提取特征。
你可以从维基百科开始学习

于 2013-11-16T12:11:30.360 回答
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I think that the Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) or Visualization Toolkit (VTK) would work well.

Some other options (that might not necessarily include all the features you want) are

于 2013-11-15T13:24:25.690 回答
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最后,我找到了我搜索并想分享的内容: https ://sites.google.com/site/cvonlinewiki/home/geometric-feature-extraction-methods

该列表看起来非常成熟和完整。

编辑 关于生物细胞特征的另一篇好文章是:

数字化显微图像上的细胞计数特征集

形状特征的一个很好的描述:http: //www.math.uci.edu/icamp/summer/research_11/park/shape_descriptors_survey.pdf

于 2014-01-08T09:56:06.677 回答