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我对 C++ 还很陌生,但是在 R 上花了很多时间。我正在尝试使用 RcppArmadillo,其中 .cpp 文件是使用 sourceCpp 函数获取的。我的示例代码来自

http://lists.r-forge.r-project.org/pipermail/rcpp-devel/2013-June/006150.html

并显示如下:

#include <RcppArmadillo.h>
using namespace Rcpp ;
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

// [[Rcpp::export]]
arma::colvec rowSumsRcppArmadillo(NumericMatrix x){
  arma::mat X = arma::mat(x.begin(), x.nrow(), x.ncol(), false);
  return arma::sum(X, 1);
}

我已经安装了 Rcpp 和 RcppArmadillo 包,并且已经成功地使用 Rcpp(没有 RcppArmadillo)来集成 C++ 函数。但是,对于 RcppArmadillo,我收到以下错误:

> sourceCpp("rowSums.cpp")
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/gcc/i686-apple-    darwin8/4.2.3/x86_64'
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/x86_64'
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/gcc/i686-apple-darwin8/4.2.3'
ld: library not found for -lgfortran
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make: *** [sourceCpp_76327.so] Error 1

...

Error in sourceCpp("rowSums.cpp") : 
Error 1 occurred building shared library.

有任何想法吗?谢谢。

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3 回答 3

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查看错误: ld: library not found for -lgfortran

您需要安装 Fortran 库,因为 RcppArmadillo 在src/Makevars

PKG_LIBS=`$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"` \
          $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)

您通过 R 获得 Lapack 和 Blas,但需要 Fortran 库。请参阅 R 的 OS X 文档,了解从何处获取此信息;我相信这个地方是Simon 在 AT&T 的页面,但我自己不是 OS X 用户。如果有疑问,请在 r-sig-mac 上询问,那里还有许多关于升级到 OS X 10.9 时发生的各种损坏的讨论线程。

于 2013-11-03T22:38:14.033 回答
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我和你遇到了同样的问题。我只是去http://cran.r-project.org/bin/macosx/tools/ 并在我的计算机上安装 gfortran-4.2.3.pkg然后使用 sourceCpp,它就可以工作了。你可以试试这个,这是我目前找到的最简单的方法。

要咨询的最新页面位于https://mac.r-project.org/tools/

于 2015-02-14T19:09:46.140 回答
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如果在您为 Mac 安装了推荐的 fortran 库之一后,像我这样的其他人在使用 Armadillo 项目时遇到类似的“构建”和“检查”问题,您需要遵循[此处的说明] 1https:/ /thecoatlessprofessor.com/programming/cpp/r-compiler-tools-for-rcpp-on-macos/

我试图更改外壳中的 LDFLAGS 环境变量,但它没有通过。但是,在 ~/.R/Makevars 中正确设置它似乎有效。

于 2014-09-15T22:42:19.153 回答