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假设我有两个不同维度的相似性矩阵,其中一些相似row.names但顺序不同,例如:

> m1
            red   yellow     blue    green    black
red    0.000000 2.236068 4.472136 6.708204 8.944272
yellow 2.236068 0.000000 2.236068 4.472136 6.708204
blue   4.472136 2.236068 0.000000 2.236068 4.472136
green  6.708204 4.472136 2.236068 0.000000 2.236068
black  8.944272 6.708204 4.472136 2.236068 0.000000

> m2
         purple    green     blue     red
purple 0.000000 0.081172 4.472136 6.708204
green  0.081172 0.000000 0.107647 4.472136
blue   4.472136 0.107647 0.000000 0.073217
red    6.708204 4.472136 0.073217 0.000000

我想子集m1到一个新矩阵,该矩阵只包含与m2. 最终结果应如下所示:

> m3
            red      blue    green    
red    0.000000  4.472136 6.708204 
blue   4.472136  0.000000 2.236068 
green  6.708204  2.236068 0.000000 

请注意,在“真实”数据中,矩阵有数百个维度。该subset命令似乎是用于参考自身的子集数据,而不是参考其他数据帧或矩阵?无论如何,我尝试像这样创建匹配的索引:

index <- m1 %in% m2 

这很好,但是在尝试使用 cbind 或 for 循环将此对象转换为新矩阵时出现错误。我知道必须有一种相当快速或优雅的方式来做到这一点,但是关于这个主题的文档似乎有点简洁。理想情况下,在转换m1为之后m3,我想对 和 的匹配元素中的值执行一些基本的算术运算,m2例如m3m2(2,3) - m3(3,2) = -2.128421。希望这是有道理的。

提前谢谢了!!

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2 回答 2

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  m3<-m1[row.names(m1) %in% row.names(m2),]
               red   yellow     blue    green    black
    red   0.000000 2.236068 4.472136 6.708204 8.944272
    blue  4.472136 2.236068 0.000000 2.236068 4.472136
    green 6.708204 4.472136 2.236068 0.000000 2.236068


     m3[,rownames(m3)]
           red     blue    green
red   0.000000 4.472136 6.708204
blue  4.472136 0.000000 2.236068
green 6.708204 2.236068 0.000000
于 2013-10-06T00:08:23.583 回答
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尝试类似的东西merge(m1,m2,all.x=FALSE,all.y=TRUE,by="colorrow")。首先必须将每个矩阵的行名放入名为colorrow.

于 2013-10-06T00:01:54.597 回答