我正在尝试找到一种将两个堆栈合并在一起的方法。例如,我正在拍摄一些关于神经元体细胞的 60X 图像,然后我将在 60X 拍摄另一叠图像以获取基底树突。那么我怎样才能将它们结合在一起呢?
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组合堆栈
您可能想要的是创建一个合成图像,每个图像堆栈形成组合多通道图像中的一个通道。您可以使用合并频道命令执行此操作:
只需分别打开每个图像堆栈,然后运行 Image > Stack > Merge Channels...,将每个图像堆栈分配给所需的通道。结果将是每个相应平面的合成。
或者,如果您的意思是以某种数学方式合并每个平面(尽管我猜不是),图像计算器命令可以使用各种操作组合两个堆栈:
图像配准/对齐
我也猜想您的图像需要先进行共同注册,特别是因为您使用alignment
.
ImageJ的斐济分布有几个很好的工具,包括:
- 逐行 ROI 对齐图像(简单/容易/快速)
- 地标通信和BUnwarpJ(更高级)
- TrakEM2(强大的重型解决方案)
- StackReg也很受欢迎
有关其他选项,请参阅斐济 wiki。
于 2013-09-26T17:45:49.393 回答
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打开所有“迷你堆栈”后,转到:图像>堆栈>工具>连接
于 2020-06-19T09:23:14.193 回答
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我不确定你所说的结合是什么意思。
合并通道创建一个复合体,其中一种颜色的体细胞堆栈和另一种颜色的树突。
如果你想让树突靠近体细胞(制作拼接马赛克),你可以使用 Stacks 下的“Combine”命令。您必须确保用于组合的边的尺寸相同。也就是说,您可以垂直组合 512x512 图像和 512 x 128 图像,并且可以水平组合 512x512 和 128x512 图像。
如果要在第一个堆栈末尾添加第二个堆栈,请使用“连接”,也在堆栈下。
于 2013-11-01T03:32:58.560 回答
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叠加荧光和DIC
- 在 ImageJ 中打开图像
- 必要时调整对比度:Image/Adjust/BrightnessConstrast
- 更改或检查所有图像均为 8 位格式。图像/类型/8 位
- 图像/颜色/合并通道和合并通道框将出现
- 在适当的 R、G 和 B 通道中选择荧光图像,在灰色通道中选择 DIC 或类似图像。选择“创建合成”并单击“确定”</li>
- 单击新的“复合”图像以激活它
- 图像/类型/RGB 颜色
- 将其保存为“Tiff”文件
于 2016-06-08T20:57:21.817 回答