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我有一个复杂的程序,用于使用 Levenberg-Marquardt 方法拟合非线性函数。

该程序使用 Lapack 库中的线性方程系统求解器,我在其中使用过:

extern "C" ...

链接到外部 fortran 库。该程序在我的笔记本电脑上运行没有问题(使用 Ubuntu 12.04),我已经使用它进行测试一段时间了。

问题:

现在我搬到了大肥64核的电脑上,为了开始做一些真正的计算,电脑上有一个科学的linux 6。原来大电脑没有安装lapack,所以我弄了lapack 3.4.2,编译,然后按照这里的说明编译:

http://matrixprogramming.com/2011/04/using-lapack-from-c/comment-page-1

在那之后,我在我之前工作的 cmake 文件中完全没有改变,只是添加了链接选项:

-L/xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2

现在我得到错误:

/usr/bin/ld: /xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2/liblapack.a(dsytrf.o): relocation R_X86_64_32 against `.rodata' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC

仅作记录,我的 cmake 脚本到处都有 -fPIC 和 -fPIE ......我使用它的链接:

target_link_libraries(LibsModule -lgsl)
target_link_libraries(LibsModule -lgslcblas)
target_link_libraries(LibsModule -lrt)
target_link_libraries(LibsModule -lpthread)
target_link_libraries(LibsModule -pie)
target_link_libraries(LibsModule -fPIC)
target_link_libraries(LibsModule -L/xdata/Compilers/Sources/lapack-3.4.2)
target_link_libraries(LibsModule -lgfortran)
target_link_libraries(LibsModule -llapack -fPIC)
target_link_libraries(LibsModule -lblas -fPIC)

我做错了什么?请指教。

谢谢你。

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解决方案是使用 -fPIC 重新编译 lapack 本身。因此,在您的 make.inc 中更改为以下内容:

FORTRAN  = gfortran -m64 -fPIC
OPTS     = -O2 -m64 -fPIC
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT    = -O0 -m64 -fPIC
LOADER   = gfortran -m64 -fPIC

你也可以使用-O3更好的优化,它工作正常!

该选项-m64取决于您是否要使用 64 位系统。你的选择!

干杯!

于 2013-09-17T07:20:35.837 回答
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如果使用mkdir build; cd build; cmake ..; make路由,请使用cmake .. -DBUILD_SHARED_LIBS=ON.

为什么会这样?-fPIC 选项使 gcc 使用相对地址 [1]
对接受的答案的评论:“更具体地说,共享库应该在进程之间共享,但可能并不总是可以在同一地址加载库两者。如果代码不是位置独立的,那么每个进程都需要自己的副本”- Simon Richter
[1] GCC -fPIC 选项

于 2019-06-05T16:01:03.130 回答