3

我尝试使用bfFixefLMER_t.fnc或fitLMER.fnc从LMERConvenienceFunctions包中。在这两种情况下，我都会收到“输入模型不是 mer 对象”的错误。

我尝试了http://artax.karlin.mff.cuni.cz/r-help/library/LMERConvenienceFunctions/html/00Index.html中的示例。我得到同样的错误。

例如，当我从示例中运行时

fitLMER.fnc(mB, backfit.on = "t", item = FALSE, 
    ran.effects = c("(FreqB | Subject)",
    "(LengthB | Subject)", "(WMC | Item)"))

这是我得到的结果。

Warning in fitLMER.fnc(mB, backfit.on = "t", item = FALSE, ran.effects = c("(FreqB | Subject)",  :resetting argument "method" to "t"

**backfitting fixed effects**

Warning in bfFixefLMER_t.fnc(model = model, item = item, method = method,  :factor variable with more than two levels in model terms, backfitting on t-values is not appropriate, please use function "bfFixefLMER_F.fnc" instead.

Error in bfFixefLMER_t.fnc(model = model, item = item, method = method,  : the input model is not a mer object

有人对这些功能有过这种经验吗？

有一些函数可以反向拟合固定效应和正向拟合随机效应。有没有办法对模型的固定效应进行前向拟合glmer？还是这在统计上毫无意义？我正在做生态建模，所以我对高级统计的理解并不多，所以，如果有人可以用外行的话更好地解释一下

sessionInfo()

R 版本 3.0.1 (2013-05-16) 平台：x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

语言环境：[1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_GB.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
[ 7] LC_PAPER=C LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C

附加的基础包：[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base

其他附加包：[1] LMERConvenienceFunctions_2.0 lme4_0.99999911-8
[3] RcppEigen_0.3.1.2.1 Rcpp_0.10.4
[5] Matrix_1.0-12 lattice_0.20-23
[7] LCFdata_1.0

通过命名空间加载（未附加）：[1] grid_3.0.1 MASS_7.3-28 minqa_1.2.1 nlme_3.1-111 rpart_4.1-2
[6] splines_3.0.1 tools_3.0.1

4

1 回答 1

4

您正在使用（旧）版本的大修lme4包，它返回merMod对象而不是mer对象，因此与LMERConvenienceFunctions. 使用即将发布的 1.0-4 版时，我遇到了同样的错误。

如果我从 CRAN 安装最新版本 (0.999999-2)，则不会出现错误。lme4我建议从 CRAN 中删除您当前的并安装最新版本，并检查其版本：

> detach("package:lme4",unload=TRUE)
> remove.packages("lme4")
> install.packages("lme4")
> packageVersion("lme4")
[1] ‘0.999999.2’

这应该可以解决您的问题。但是请注意，您将失去新版本的优势。

此外，在接下来的几天里，新的lme4应该会出现在 CRAN 上，LMERConvenienceFunctions如果你更新你的包，它会再次中断。然而，我猜想，作者LMERConvenienceFunctions将很快更新他们的包以再次兼容。

于 2013-09-13T17:53:17.757 回答