我有一个脚本，它接受三个参数并像这样运行：
myscript.sh input1.fa input2.fa out.txt
input1.fa该脚本从和中各读取一行input2.fa，进行一些比较，然后将结果写入out.txt。这两个输入需要具有相同的行数，并且out.txt在脚本完成后也将具有相同的行数。
是否可以使用 GNU 并行化parallel？
我不在乎输出的顺序与输入的顺序不同，但我确实需要将 的i第 行input1.fa与 的i第 行进行比较input2.fa。此外，如果我得到多个输出文件（如output{#}）而不是一个，这是可以接受的——我会把cat它们放在一起。
我找到了这个话题，但答案并不是我想要的。我知道我可以split使用两个输入文件并成对并行处理它们xargs，但如果可能的话，我想在一行中执行此操作...