17

我正在尝试使用 ggplot 创建几个图表。这些图表是一系列条形图,它们也一起描述了一条线示例 (顺便说一句,是的,我意识到调色板很难看,它对色盲很友好,这对我的观众很重要)

我的问题是我需要制作几个这样的图表,并且我希望颜色在所有这些图表中保持一致。由于“类型”变量在我将要使用的几个数据集中以不同的顺序出现,因此我需要为每种类型手动设置颜色。我认为这个问题:如何在 ggplot2 直方图中手动填充颜色会有答案,但是当我尝试这样做时,它会将图例中的名称更改为颜色的十六进制定义,但颜色本身会回到 ggplot 的默认值调色板。

这是我到目前为止的代码:

  cbbPalette <- c("#000000", "#E69F00", "#56B4E9", "#009E73", "#F0E442", "#0072B2", "#D55E00", "#CC79A7")

 ggplot()+
    scale_fill_manual(values=cbbPalette)+
    geom_bar(data=subset(eten, Type=="Waste Wood"), aes(x=Tprod, y=acost, fill=cbbPalette[1], width=MGGEY+25), stat="identity")+
    geom_bar(data=subset(eten, Type=="Agricultural Residue"), aes(x=Tprod, y=acost, fill=cbbPalette[2], width=MGGEY+25), stat="identity")+
    geom_bar(data=subset(eten, Type=="Forest Residue"), aes(x=Tprod, y=acost, fill=cbbPalette[3], width=MGGEY+25), stat="identity")+
    geom_bar(data=subset(eten, Type=="Herbaceous Energy Crop"), aes(x=Tprod, y=acost, fill=cbbPalette[4], width=MGGEY+25), stat="identity")+
    geom_bar(data=subset(eten, Type=="MSW"), aes(x=Tprod, y=acost, fill=cbbPalette[5], width=MGGEY+25), stat="identity")+
    scale_y_continuous("Average Cost", labels = dollar, expand=c(0,0))+
    scale_x_continuous("Million Gallons of Gasoline Equivalent", expand=c(0,0))+
    theme(legend.position="bottom", panel.background=element_rect(colour = NA, fill = "white"), axis.line=element_line(), panel.grid.major.y=element_line(colour="black"), panel.grid.minor=element_blank())

我的 R 专业知识水平相当低,所以我可能遗漏了一些简单的东西,但我无法独自完成它。在此先感谢您的帮助。

更新:我无意中粘贴了错误版本的代码,“填充”命令又回到了我的最佳猜测。示例数据集在这里

4

2 回答 2

21

我猜你看过这里显示的 ggplot 色盲示例?如果没有您的数据,我只能推测您的 geom_bar 调用会产生歧义,因为您对 ggplot 的初始调用没有 aes 参数。尝试将所有数据移动到单个数据框中,并在对 ggplot 的初始调用中引用它,例如,

ggplot(df, aes(x=cond, y=yval)) +
    geom_bar() + 
    scale_fill_manual(values=cbbPalette)

其中 df 是包含数据的数据框, aes 是变量之间的映射。这让 ggplot 清楚地知道您希望 geom_bar 的填充颜色与 df 中的数据相对应。有一些方法可以使用您当前的代码进行此操作,但它们对于创建标准条形图是非常规的。

于 2013-08-14T18:57:24.237 回答
8

Jay B. Martin的回答并没有完全回答这个问题。因此,尽管这个问题已经很老了,但这里有一个解决方案供将来参考。我们为可重现的示例制作了一些数据:

color_table <- tibble(
  Land_cover = c("Agriculture", "Forest", "Ocean", "Lake", "Populated"),
  Color = c("yellow", "darkgreen", "blue4", "lightblue", "maroon3")
  )

df <- data.frame(
  Region = c(rep(1,5), rep(2,5)),
  Area_no = c(1,2,3,4,5,1,2,3,4,5),
  Land_cover = c("Agriculture", "Forest", "Agriculture", "Agriculture", "Lake", 
                 "Lake", "Populated", "Populated", "Ocean", "Populated"), 
  Square_km = c(10,15,7,12,3, 5,30,20,40,10)
  )

因此,我们想用df为每个 制作一个图形Region,其中Land_cover由 给出的正确颜色表示color_table。首先,我们必须确保Land_cover数据集中的df变量是一个因子变量,其顺序与我们要放置在每种土地覆盖类型上的颜色相同。我们通过使用来自的顺序来做到这一点color_table

df$Land_cover <- factor(df$Land_cover, levels = color_table$Land_cover)

现在,使用正确颜色进行绘图的最简单方法是,正如 Jay B. Martin 在评论中建议的那样,使用 facet_grid() 或 facet_wrap():

ggplot(df, aes(x = Area_no, y = Square_km, fill = Land_cover)) +
  geom_col() +
  scale_fill_manual(values = color_table$Color) +
  facet_grid(.~Region) 

使用构面的ggplot 但是如果你想为每个区域制作一个单独的图呢?例如,您希望将每个图保存为单独的文件。

问题

如果我们基本上创建一个小循环,在其中选择数据的子集并重用我们上面使用的代码(除了facet_grid),我们显然会得到错误的颜色(这里显示的是区域 2):

for (region in 1:2){
  gg <- ggplot(subset(df, Region %in% region), aes(x = Area_no, y = Square_km, fill = 
  Land_cover)) +
    geom_col() + 
    scale_fill_manual(values = color_table$Color) 
  ggsave(paste0("Areas_region_", region, ".png"), width = 5, height = 3)
  }

用错误的颜色绘制

有两种方法可以获得正确的颜色:

解决方案 1. drop = FALSE(图例显示所有类别)

到目前为止,添加drop = FALSE内部scale_fill_manual是最简单的。然后,您将获得正确的颜色,图例将显示所有可能的类别,而不仅仅是图中的类别:

for (region in 1:2){
  gg <- ggplot(subset(df, Region %in% region), aes(x = Area_no, y = Square_km, fill = 
  Land_cover)) +
    geom_col() + 
    scale_fill_manual(values = color_table$Color, drop = FALSE) 
  ggsave(paste0("Areas_region_", region, ".png"), width = 5, height = 3)
  }

绘制所有类别的正确颜色和图例

解决方案 2. 为每个绘图选择颜色(图例仅显示绘图中显示的类别)

如果由于某种原因您不希望图例显示所有可能的类别(例如,如果有大量类别),则需要为每个图选择正确的颜色:

library(magrittr)
for (region in 1:2){
  df_plot <- subset(df, Region %in% region)
  actual_cover <- df_plot$Land_cover %>% as.numeric() %>% table() %>% names() %>% as.numeric()
  gg <- ggplot(df_plot, aes(x = Area_no, y = Square_km, fill = Land_cover)) +
    geom_col() + 
    scale_fill_manual(values = color_table$Color[actual_cover])
  ggsave(paste0("Areas_region_", region, "ver3.png"), width = 5, height = 3)
  }

这导致以下图(对于区域 2): 绘制所有类别的正确颜色和图例

我们在这里实际做的是创建一个向量actual_cover,其中包含当前绘图中实际使用的颜色(数字 1-6)。因此,图例仅包含图中存在的类别,而颜色仍然正确。

于 2018-06-19T14:34:20.003 回答