image - 在命令提示符下使用 imagej 打开 raw

Question

我正在尝试创建一个 .bat 文件来读取 .bsv 文件并将它们转换为彩色 png。第一部分是使用 imagej 打开 .bsv，然后使用我添加的“全部保存”插件。我尝试制作一个宏，但它只会给我错误。在命令提示符下，我将如何使用图像 j 执行以下操作：

File->import->raw->myfile.bsv 并选择 8-bit, width: 4000, height: 2672, offset to first image: 0, image number: 40, gap between images: 0, little-endian byte order .

然后

插件->全部保存

谢谢你尽你所能的帮助！

Answer 1

使用 ImageJ 中的宏记录器（Plugins > Macros > Record...），您描述的过程会生成以下代码：

run("Raw...", "open=/path/to/myfile.bsv image=8-bit width=4000 height=2672 offset=0 number=40 gap=0 little-endian");
run("Save All");

如果您将此宏文件保存为mymacro.ijm，您应该能够使用如下宏选项运行 ImageJ（取决于您的平台）：

-macro mymacro.ijm

希望有帮助。