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我对 knitr 包有点迷茫。我喜欢 spin() 函数，它可以快速为我提供分析的全局视图，但我需要将一些非常重要的图保存在单独的 pdf 中（例如，我的文件的第 8 个图应保存为“Figure1.pdf”并显示在报告中）。

当我写：

Some random code and plots...

pdf('Figure1.pdf')
plot(important plot)
dev.off()

Some random code and plots

自旋（）之后，重要的情节不会显示在报告中，我想在报告和 pdf 中。

有什么办法吗？

谢谢

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spin()保存所有绘图，尽管默认情况下它以 PNG 格式保存绘图，因为参数spin(..., format = 'Rmd')（R Markdown 使用 PNG 设备）。

您也可以在 R 脚本中指定块选项：只需使用#+or #-，例如

#' Some random code and plots...

#+ Figure1, fig.path='', dev=c('png', 'pdf')
plot(important plot)

#' Some random code and plots

请注意dev，如@baptiste 所述，该选项采用设备向量。

或者你使用 Rnw 格式，例如（你不需要指定dev）

spin(..., format = 'Rnw')

在这种情况下，输出将是 LaTeX/PDF 而不是 HTML。

于 2013-07-25T03:59:27.123 回答
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如果我理解了这个问题，在关闭设备后重复绘图语句就可以了，而不会在报告中产生重复：

Some random code and plots...

pdf('Figure1.pdf')
plot(important plot)
dev.off()
plot(important plot)

Some random code and plots
于 2013-09-12T04:59:54.327 回答