r - 使用 ggplot2 绘制多面或非多面（即重叠）时的不同直方图

Question

我正在运行一个引导程序，以便更好地了解我从基于相对少量参与者的混合模型中获得的一些统计数据。对于两种情况，我正在绘制自举平均值的直方图（链接到数据）。

问题是，当我将直方图绘制在彼此之上（一个刻面/面板）时，我会看到 B 处理的清晰双峰直方图，但是在使用每个处理的刻面进行绘制时，这个双峰会消失。

p <- ggplot(data=bstr3, mapping=aes(x=m, fill=treatment)) +
  geom_histogram(binwidth=1, alpha=0.4) + 
  scale_fill_manual(values=c('A'='red', 'B'='blue')) 
p + coord_cartesian(xlim=c(-60, 0))

但是，当我将处理绘制为刻面时，双峰消失了。

p + facet_wrap(~treatment, ncol=1) + coord_cartesian(xlim=c(-60, 0))

根据 ggplot 书和互联网，我无法理解这是/为什么这是有意的或潜在的错误。我确实发现这个问题暗示了一个错误，但这篇文章已经有一年了，我有 R 和 ggplot2 的最新更新。

R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] graphics  grDevices utils     datasets  stats     methods   base     

other attached packages:
[1] plyr_1.8             reshape2_1.2.2       knitrBootstrap_0.6.5
[4] markdown_0.6.1       knitr_1.3            ggplot2_0.9.3.1     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] colorspace_1.2-2   dichromat_2.0-0    digest_0.6.3       evaluate_0.4.4    
 [5] formatR_0.8        grid_3.0.1         gtable_0.1.2       labeling_0.2      
 [9] MASS_7.3-27        munsell_0.4.2      proto_0.3-10       RColorBrewer_1.0-5
[13] scales_0.2.3       stringr_0.6.2      tools_3.0.1       

Answer 1

The default position adjustment used by geom_histogram is position_stack (which seems a strange default for histograms). You want position_identity.

set.seed(42)
DF <- data.frame(x=rnorm(1000,5,0.5),y=rnorm(1000,7,1))
library(reshape2)
DF <- melt(DF)

library(ggplot2)
p <- ggplot(data=DF, mapping=aes(x=value, fill=variable)) +
  geom_histogram(binwidth=1, alpha=0.4) + 
  scale_fill_manual(values=c('x'='red', 'y'='blue')) 
print(p)

p <- ggplot(data=DF, mapping=aes(x=value, fill=variable)) +
  geom_histogram(binwidth=1, alpha=0.4, position="identity") + 
  scale_fill_manual(values=c('x'='red', 'y'='blue')) 
print(p)