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我有一个使用 ggsave 保存一些图的 R 脚本。当我从命令行运行脚本时,它不仅保存了我的图,还保存了一个空的 Rplots.pdf 文件。如何防止 R 创建这个不必要的文件?

这是一个重现错误的示例脚本:

#!/usr/bin/env Rscript

# Code that creates unnecessary Rplots.pdf file
library(ggplot2)
my.data <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10)
my.plot <- qplot(x, y, data = my.data)
ggsave('example.png', my.plot) 

以下所有运行脚本的方式都会创建不必要的文件:

Rscript script.R
Rscript --vanilla script.R
chmod a+x script.R
./script.R 

此外,当我从交互式会话中获取代码时,会打开一个不必要的空白 R 图形设备窗口。

此外,如果我使用以下更详细的代码代替 ggsave,我不会遇到这些问题:

#!/usr/bin/env Rscript

# Code that does NOT create unnecessary Rplots.pdf file
library(ggplot2)
my.data <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10)
my.plot <- qplot(x, y, data = my.data)
png(file = 'example.png')
print(my.plot)
dev.off()

这是我的会话信息(无论是运行 Rscript 还是以交互方式运行都相同):

R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] methods   stats     graphics  grDevices utils     datasets  base     

other attached packages:
[1] ggplot2_0.9.3.1

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] colorspace_1.2-2   dichromat_2.0-0    digest_0.6.3       grid_3.0.1        
 [5] gtable_0.1.2       labeling_0.1       MASS_7.3-26        munsell_0.4       
 [9] plyr_1.8           proto_0.3-10       RColorBrewer_1.0-5 reshape2_1.2.2    
[13] scales_0.2.3       stringr_0.6.2   

5年后更新(2018-08-02):这个问题来来去去。ggplot2 2.2.1 不会产生空文件,ggplot2 3.0.0 会产生,而 ggplot2 团队目前正在努力解决这个问题。有关开发历史,请参阅 ggplot2 问题#1326#2363#2758#2787

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2 回答 2

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如果您查看 中的宽度和高度参数的默认值ggsave,您会发现它们是par("din")[1]par("din")[2]。如果你在控制台中运行它,你会看到它打开了一个图形窗口,如果还没有打开的话。

这是有道理的,因为为了获得以英寸为单位的设备宽度/高度,您需要一个实际的设备。我想有人可能会争辩说,par("din")如果没有设备打开,应该返回一个错误,在这种情况下,Hadley 肯定会以ggsave不同的方式编写。

确实,来自?par

如果当前设备为空设备,par 会在查询/设置参数前打开一个新设备。

因此,指定宽度/高度将防止虚假设备打开。

于 2013-06-27T16:48:31.530 回答
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另一种解决方案是使用包R.devices来抑制打开的图形设备ggsave

library(R.devices)
suppressGraphics(ggsave('example.png', my.plot))

有关另一个示例,请参见包作者的推文。

于 2018-08-02T14:14:58.253 回答