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我正在使用 ggplot2 对两种不同的物种进行箱线图比较，如下图的第三列所示：

> library(reshape2)
> library(ggplot2)
> melt.data = melt(actb.raw.data)

> head(actb.raw.data)
  region  expression species
1     CG -0.17686667   human
2     CG -0.06506667   human
3     DG  1.04590000   human
4    CA1  1.94093333   human
5    CA2  1.55023333   human
6    CA3  1.75800000   human

> head(melt.data)
  region species   variable       value
1     CG   human expression -0.17686667
2     CG   human expression -0.06506667
3     DG   human expression  1.04590000
4    CA1   human expression  1.94093333
5    CA2   human expression  1.55023333
6    CA3   human expression  1.75800000

但是，当我运行以下代码时：

ggplot(combined.data, aes(x = region, y = expression, fill = species)) +
+     geom_boxplot() +
+     scale_fill_manual(values = c("yellow", "orange"))
+     ggtitle("Expression comparisons for ACTB")
+     theme(axis.text.x = element_text(angle=90, face="bold", colour="black"))

我收到此错误：

> ggplot(actb.raw.data, aes(x = region, y = expression, fill = species)) +
+     + geom_boxplot() +
+     + scale_fill_manual(values = c("yellow", "orange"))
Error in +geom_boxplot() : invalid argument to unary operator
> + ggtitle("ACTB expression in human vs. macaque")
Error in +ggtitle("ACTB expression in human vs. macaque") : 
 invalid argument to unary operator
> + theme(axis.text.x = element_text(angle=90, face="bold", colour="black"))
Error in inherits(x, "theme") : argument "e2" is missing, with no default

当我使用变量 melt.data 运行时，也会发生这种情况，无论它值多少钱。有人可以帮我解决这个问题吗？我之前使用格式相同的不同数据集成功运行了此代码，但我无法弄清楚这里出了什么问题。

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4 回答 4

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看起来您可能+在每行的开头插入了一个额外的内容，R 将其解释为一元运算符（如-解释为否定，而不是减法）。我认为可行的是

ggplot(combined.data, aes(x = region, y = expression, fill = species)) +
    geom_boxplot() +
    scale_fill_manual(values = c("yellow", "orange")) + 
    ggtitle("Expression comparisons for ACTB") + 
    theme(axis.text.x = element_text(angle=90, face="bold", colour="black"))

也许您从 R 控制台的输出中复制并粘贴？当输入不完整时，控制台+在行首使用。

于 2013-06-21T17:01:23.853 回答
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在 R 中发布多行命令时，这是众所周知的麻烦事。source()（当您使用脚本复制和粘贴行时，您可以获得不同的行为，包括多行和注释）

规则：始终将悬空的“+”放在行尾，以便 R 知道命令未完成：

ggplot(...) + geom_whatever1(...) +
  geom_whatever2(...) +
  stat_whatever3(...) +
  geom_title(...) + scale_y_log10(...)

不要将悬空的“+”放在行首，因为这会引起错误：

Error in "+ geom_whatever2(...) invalid argument to unary operator"

显然不要在两端和开头都加上悬空的“+”，因为这是一个语法错误。

因此，要养成保持一致的习惯：始终将“+”放在行尾。

参看。回答“在 R 脚本中将代码拆分为多行”

于 2014-03-29T12:56:13.090 回答
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是行首的“+”运算符使事情出错（不仅仅是您连续使用两个“+”运算符）。'+' 运算符可以用在行尾，但不能用在开头。

这有效：

ggplot(combined.data, aes(x = region, y = expression, fill = species)) +
geom_boxplot()

不：

ggplot(combined.data, aes(x = region, y = expression, fill = species))
+ geom_boxplot() 

*Error in + geom_boxplot():
invalid argument to unary operator*

您也不能使用两个“+”运算符，在这种情况下您已经完成了。但要解决这个问题，您必须有选择地删除行首的那些。

于 2013-11-06T21:30:49.157 回答
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尝试将语法合并到一行中。这将清除错误

于 2019-11-28T07:46:35.137 回答