r - 从 ggplot 中消除 NA

Question

这是一个非常基本的问题，因为我刚开始使用 R，但我正在尝试在 ggplot2 中创建因子计数的条形图，并且在绘图时，得到 14 个代表我的实际水平的小彩色光点，然后是一个巨大的灰色条end 代表样本中的 5000-ish NA（它是来自仅适用于样本约 5% 的问题的调查数据）。我试过以下代码无济于事：

ggplot(data = MyData,aes(x= the_variable, fill=the_variable, na.rm = TRUE)) + 
   geom_bar(stat="bin") 

此处添加 na.rm 参数没有明显效果。

同时

ggplot(data = na.omit(MyData),aes(x= the_variable, fill=the_variable, na.rm = TRUE)) + 
   geom_bar(stat="bin") 

给我

“错误：美学长度必须为一，或与数据长度相同”

将 附加na.omit()到 the_variable 或 MyData 和 the_variable 也是如此。

我想做的就是从我的图表中消除巨大的 NA 条，有人可以帮我这样做吗？

Answer 1

可以使用subset里面的函数ggplot2。尝试这个

library(ggplot2)

data("iris")
iris$Sepal.Length[5:10] <- NA # create some NAs for this example

ggplot(data=subset(iris, !is.na(Sepal.Length)), aes(x=Sepal.Length)) + 
geom_bar(stat="bin")

Answer 2

只是对@rafa.pereira 答案的更新。由于ggplot2是 的一部分tidyverse，因此使用方便的 tidyverse 函数来摆脱 NA 是有意义的。

library(tidyverse)
airquality %>% 
        drop_na(Ozone) %>%
        ggplot(aes(x = Ozone))+
        geom_bar(stat="bin")

请注意，您也可以使用drop_na()无列规范；然后将删除任何列中具有 NA 的所有行。

Answer 3

此外，将 na.rm= TRUE 添加到您的 geom_bar() 将起作用。

ggplot(data = MyData,aes(x= the_variable, fill=the_variable, na.rm = TRUE)) + 
   geom_bar(stat="bin", na.rm = TRUE)

我在时间序列中遇到了这个问题，并解决了这个问题。删除丢失的数据，否则结果不受影响。

Answer 4

不确定您是否已解决问题。对于这个问题，您可以使用 dplyr 包中的“过滤器”功能。这个想法是过滤您感兴趣的变量的值不是 NA 的观察值/行。接下来，您使用这些过滤后的观察结果制作图表。您可以在下面找到我的代码，并注意数据框和变量的所有名称都是从您的问题提示中复制的。另外，我假设您知道管道操作员。

library(tidyverse) 

MyDate %>%
   filter(!is.na(the_variable)) %>%
     ggplot(aes(x= the_variable, fill=the_variable)) + 
        geom_bar(stat="bin") 

您应该能够删除情节上烦人的 NA。希望这有效:)

Answer 5

尝试remove_missing使用vars = the_variable. 设置vars参数非常重要，否则remove_missing将删除任何列中包含的所有行NA！设置na.rm = TRUE将抑制警告信息。

ggplot(data = remove_missing(MyData, na.rm = TRUE, vars = the_variable),aes(x= the_variable, fill=the_variable, na.rm = TRUE)) + 
       geom_bar(stat="bin") 

Answer 6

从我的角度来看，这个错误“错误：美学必须是长度为一，或者与数据的长度相同”是指参数 aes(x,y) 我尝试了 na.omit() 并且对我来说工作得很好。