r - readFASTA VS read.fasta

Question

我是 R 新手，遇到 biostrings 函数 readFASTA 的问题。最新版本的 biostringsR 3.0.1是不同的。以前的版本似乎正在完成这项工作。因此我开始使用read.fastaseqin R 中的函数。我正在从 fasta 文件中读取 DNA 序列。

readFASTA阅读顺序如下

[[9999]]

[[9999]]$desc

[1] "9320"


[[9999]]$seq

[1]

"TCCCCTGAAATTCCCCC"

现在read.fasta正在将序列读取为

[[4746]]

[1] "AACACAACCTCATTCCC"

使用$以前版本中的运算符，我可以拆分序列和基因，但使用当前版本我不知道该怎么做。无论如何我可以获得与从readFASTA.