python - 在python中转置一个大的制表符分隔文件

Question

我正在尝试转置一个包含大约 6000 行和 200 万列的巨大制表符分隔文件。最好的方法不应该涉及将整个文件保存在内存中，这似乎是这个问题的答案：

如何对csv表中的数据进行行到列的转置？

Answer 1

一种方法是为每一列迭代输入文件一次（未经测试的代码！）：

with open("input") as f, open("output", "w") as g:
    try:
        for column_index in itertools.count():
            f.seek(0)
            col = [line.split("\t")[column_index] for line in f]
            g.write("\t".join(col) + "\n")
    except IndexError:
        pass

这将非常慢，但一次只能在内存中保留一行。