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我想使用 OpenMP 并行填充直方图。我想出了两种不同的方法来使用 C/C++ 中的 OpenMP 执行此操作。

第一种方法为每个线程proccess_data_v1创建一个私有直方图变量hist_private,将它们并行填充,然后将私有直方图相加到hist一个critical部分中的共享直方图中。

第二种方法proccess_data_v2制作一个数组大小等于线程数的共享直方图数组,并行填充该数组,然后并行对共享直方图求和hist

第二种方法似乎优于我,因为它避免了关键部分并并行汇总直方图。但是,它需要知道线程数并调用omp_get_thread_num(). 我通常会尽量避免这种情况。有没有更好的方法来执行第二种方法而不引用线程号并使用大小等于线程数的共享数组?

void proccess_data_v1(float *data, int *hist, const int n, const int nbins, float max) {
    #pragma omp parallel 
    {
        int *hist_private = new int[nbins];
        for(int i=0; i<nbins; i++) hist_private[i] = 0;
        #pragma omp for nowait
        for(int i=0; i<n; i++) {
            float x = reconstruct_data(data[i]);
            fill_hist(hist_private, nbins, max, x);
        }
        #pragma omp critical 
        {
            for(int i=0; i<nbins; i++) {
                hist[i] += hist_private[i];
            }
        }
        delete[] hist_private;
    }
}

void proccess_data_v2(float *data, int *hist, const int n, const int nbins, float max) {
    const int nthreads = 8;
    omp_set_num_threads(nthreads);
    int *hista = new int[nbins*nthreads];

    #pragma omp parallel 
    {
        const int ithread = omp_get_thread_num();
        for(int i=0; i<nbins; i++) hista[nbins*ithread+i] = 0;
        #pragma omp for
        for(int i=0; i<n; i++) {
            float x = reconstruct_data(data[i]);
            fill_hist(&hista[nbins*ithread], nbins, max, x);
        }

        #pragma omp for
        for(int i=0; i<nbins; i++) {
            for(int t=0; t<nthreads; t++) {
                hist[i] += hista[nbins*t + i];
            }
        }

    }
    delete[] hista;
}

编辑: 根据@HristoIliev 的建议,我创建了一个改进的方法,称为process_data_v3

#define ROUND_DOWN(x, s) ((x) & ~((s)-1))
void proccess_data_v2(float *data, int *hist, const int n, const int nbins, float max) {
    int* hista;
    #pragma omp parallel 
    {
        const int nthreads = omp_get_num_threads();
        const int ithread = omp_get_thread_num();

        int lda = ROUND_DOWN(nbins+1023, 1024);  //1024 ints = 4096 bytes -> round to a multiple of page size
        #pragma omp single
        hista = (int*)_mm_malloc(lda*sizeof(int)*nthreads, 4096);  //align memory to page size

        for(int i=0; i<nbins; i++) hista[lda*ithread+i] = 0;
        #pragma omp for
        for(int i=0; i<n; i++) {
            float x = reconstruct_data(data[i]);
            fill_hist(&hista[lda*ithread], nbins, max, x);
        }

        #pragma omp for
        for(int i=0; i<nbins; i++) {
            for(int t=0; t<nthreads; t++) {
                hist[i] += hista[lda*t + i];
            }
        }

    }
    _mm_free(hista);
}
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您可以在并行区域内分配大数组,您可以在其中查询正在使用的实际线程数:

int *hista;
#pragma omp parallel 
{
    const int nthreads = omp_get_num_threads();
    const int ithread = omp_get_thread_num();

    #pragma omp single
    hista = new int[nbins*nthreads];

    ...
}
delete[] hista;

为了获得更好的性能,我建议您将每个线程块的大小四舍五入为hista系统内存页面大小的倍数,即使这可能会在不同的部分直方图之间留下漏洞。这样,您将防止 NUMA 系统上的错误共享和远程内存访问(但不是在最终缩减阶段)。

于 2013-05-28T12:05:37.367 回答