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当我使用

os.environ.keys()

在命令行中,我得到与 cgi 脚本不同的环境变量。有没有办法通过 cgi 脚本获取 python 环境变量?

使用

subprocess.Popen

我没有得到相同的参数。

你能帮我吗?

编辑:

例如在命令行中我的环境参数是

['rvm_version', 'rvm_path', 'LESSOPEN', 'escape_flag', 'SSH_CLIENT', 
'LOGNAME', 'USER', 'HOME', 'PATH', 'RDBASE', 'LD_LIBRARY_PATH', 'LANG',           
'TERM', 'SHELL', '_first', 'SHLVL', '__array_start', 'G_BROKEN_FILENAMES', 
'HISTSIZE', 'LISISTOOLS_PATH', 'GEM_PATH', 'rvm_bin_path', 'rvm_prefix', 
'PYTHONPATH', 'IRBRC', 'AUTODOCK_PATH', 'MY_RUBY_HOME', 'BOOST', '_', 
 '_second', 'SSH_CONNECTION', 'RUBY_VERSION', 'GRANATUM_LICENSE_FILE',      
 'OLDPWD', 'HOSTNAME', 'HISTCONTROL', 'PWD', 'SSH_TTY', 'MAIL', 'LS_COLORS', 
 'GEM_HOME', 'MGLTOOLS']

但从我的 cgi 脚本中是:

['HTTP_COOKIE', 'SERVER_SOFTWARE', 'SCRIPT_NAME', 'SERVER_SIGNATURE', 
'REQUEST_METHOD', 'SERVER_PROTOCOL', 'QUERY_STRING', 'PATH', 'DUMP_FILE', 
'HTTP_ACCEPT_CHARSET', 'HTTP_USER_AGENT', 'HTTP_CONNECTION', 'HTTP_REFERER', 
'SERVER_NAME', 'REMOTE_ADDR', 'SERVER_PORT', 'SERVER_ADDR', 'DOCUMENT_ROOT', 
'SCRIPT_FILENAME', 'SERVER_ADMIN', 'HTTP_HOST', 'REQUEST_URI', 'HTTP_ACCEPT',         
'GATEWAY_INTERFACE', 'REMOTE_PORT', 'HTTP_ACCEPT_LANGUAGE',     
'HTTP_ACCEPT_ENCODING']

我想要通过 cgi-script 的第一组环境变量(命令行)。

当我导入 cgi 脚本时

from rdkit import Chem

我得到错误

 /home/galaxy/working/RDKit/rdkit/Chem/__init__.py in ()
16  
17 """
18 from rdkit import rdBase
<type 'exceptions.ImportError'>: libRDGeneral.so.1: cannot open shared object 
file: No such file or directory 
  args = ('libRDGeneral.so.1: cannot open shared object file: No such file or 
         directory',) 
  message = 'libRDGeneral.so.1: cannot open shared object file: No such file 
         or directory'

但在命令行中我没有收到任何错误。

PYTHONPATH包含

'/home/galaxy/working:/home/galaxy/working/RDKit:/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/MGLToolsPckgs:/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/MGLToolsPckgs'

我使用更新 sys.path

 sys.path.append('/home/galaxy/working')
 sys.path.append('/home/galaxy/working/RDKit')
 sys.path.append('/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/
 MGLToolsPckgs')
 sys.path.append('/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/      
 MGLToolsPckgs')
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2 回答 2

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您误解了这种情况:os.environ仅为您提供操作系统提供的进程环境的值。您的 CGI 脚本在 Apache 下运行,因此当您从命令行运行它时,它具有与同一脚本不同的环境。(例如,USER必然会有所不同)。

简而言之,您所要求的不存在。您正在获取 python 环境变量,它们不是您所期望的。请解释您要完成的工作,即为什么您要尝试获得这些环境值。我可以告诉您如何设置您的 CGI 脚本,使其环境与您的命令行环境相匹配,但谁知道这是否是您需要的?

编辑:所以你的目标是导入一个模块。您可以通过将目录附加到sys.path(列表)来动态更改模块导入路径。尝试显式添加rdkit. 你不需要环境。

于 2013-05-16T14:20:27.937 回答
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我认为你可以做到

subprocess.Popen([cmd],env={'my':'environment','vars':4, ...})

并强制一组特定的环境变量

于 2013-05-16T13:38:06.653 回答