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我正在做一些分析工作，在相同样本之间运行软件后，我得到了这样的输出

>software1
>id sample1 sample2
 a  0           0
 b  0           0
 c  0           0
 d  0           0
 e  0           0
 f  0           0
 g  0.518775    0.549079
 h  0.0233247   0.101596
 i  15.8679     15.45


>software2
>id sample1 sample2
 a     0    0
 b     0    0
 c     0    0
 d     0    0
 e     0    0
 f     0    0
 g    18.6225669551756  23.7346441585572
 h   199.37101093188    157.926670747323
 i    10.9544511501033  3.65148371670111

现在我想比较或关联使用的不同软件之间的样本......比如软件1的样本1和软件2的样本1和软件1的样本2和软件2的样本2

我是 R 的新手并且正在学习它，任何帮助都会很棒吗？

我现在使用 cor 函数计算了样本之间的相关性。我可以在它们之间开发热图吗？

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1 回答 1

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cor(software1[c("sample1", "sample2")],
    software2[c("sample1", "sample2")])

#             sample1    sample2
# sample1 -0.08296432 -0.1202152
# sample2 -0.07804807 -0.1151872

我会注意到，这些示例中的零数量提出了一个问题，即与相关性不同的汇总方法是否更可取。Pearson 相关假设这两个向量是从重复概率低的连续分布中提取的。

于 2013-05-06T22:53:46.080 回答