biopython - 取来的氨基酸变色

Question

我想编写一个 PyMOL 脚本来改变 XYZ 位置的氨基酸颜色（或者以某种方式在 XYZ 位置放置一些带有标签的标记）。

有人知道怎么做这个吗 ？

谢谢

Answer 1

你知道PyMOL 中的伪原子和标签吗？

# to create a banner at certain position
pseudoatom mypsatm, pos=[10.0,10.0,10.0]  
show spheres, mypsatm
color red, mypsatm                     # now you see me
hide everything, mypsatm
label mypsatm, 'How about this'        # only show banner  

# to select residues close to that position
select mysel, byres mypsatm around 4   # 4 Angstroms around mypsatm