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我尝试使用WinBUGSfrom Rvia BRugsand R2WinBUGS，代码如下：

require(R2WinBUGS)
require(BRugs)
model<-function(){
  for(i in 1:N){
    y[i] <- x[i] + w[i]
    w[i] ~ dnorm(0, sigma.y)
    x[i] <- a - b*5 + v[i]
    v[i] ~ dnorm(0, sigma.x)
  }
a ~ dunif(0, 1)
b ~ dunif(-1, 1)
sigma.y ~ dgamma(0.1, 0.1)
sigma.x ~ dgamma(0.1, 0.1)
}

write.model(model, con = "model.bug")
modelCheck("model.bug")
# model is syntactically correct

N = 10
y = rnorm(100)
data = list(N = N, y = y)
inits = function(){
  list(a = runif(1, 0, 1), b = runif(1, -1, 1), sigma.x= rgamma(1, 0.1, 0.1), 
       sigma.y = rgamma(1, 0.1, 0.1))
}
parameters = c("a", "b", "sigma.x", "sigma.y")

result.sim <- bugs(data, inits, parameters, "model.bug",
                n.chains = 1, n.iter = 1000,
                program= "winbugs",
                working.directory = NULL,
                debug = T)

结果没有出来，我发现了部分log.txt的WinBUGS：

display(log)
check(C:/Users/ADMINI~1.PC-/AppData/Local/Temp/RtmpkrnOoc/model.bug.txt)
model is syntactically correct
data(C:/Users/ADMINI~1.PC-/AppData/Local/Temp/RtmpkrnOoc/data.txt)
data loaded
compile(1)
multiple definitions of node y[1]
inits(1,C:/Users/ADMINI~1.PC-/AppData/Local/Temp/RtmpkrnOoc/inits1.txt)
command #Bugs:inits cannot be executed (is greyed out)
gen.inits()
command #Bugs:gen.inits cannot be executed (is greyed out)
thin.updater(1)
update(500)
command #Bugs:update cannot be executed (is greyed out)
set(a)

很明显erroris multiple definitions of node y[1]，但它是什么意思？我不认为y[1]有多个定义，因为我使用y[i]但y不在loop.

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当您没有正确定义模型的可能性时，您往往会遇到多重定义错误。如果您有y数据，则需要y在模型中声明分布。目前，您y在模型中设置为确定性（而不是随机）节点。根据您的实际型号，您可以设置

y[i] ~ dnorm(x[i], w[i])

然后，您必须在每个容差 w[i] 上具有不同的先验分布（仅是正的）。

于 2013-04-17T11:48:15.650 回答
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在您的模型中，y[i] 具有正态分布，均值 x[i]，方差由 v[i] 的方差加上 w[i] 的方差定义。这将为您提供在 y[i] ~ dnorm(x[i] , prec[i]) 中使用的适当参数。请注意，BUGS 中的正态分布由精度 = 1 / 方差定义，因此 prec[i] <- 1 / (1/sigma.y + 1/sigma.x)。假设 sigma 是精度 - 尽管这是令人困惑的符号，因为 sigma 通常是标准偏差。

于 2013-04-19T08:55:48.170 回答