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我这里有问题。

Seq1 [有机体=Carpodacus mexicanus] C.mexicanus 克隆
CCTTTATCTTTATCTAGGAGCATGAGCTGGCATAGTTGGAACCGCCCTCAGCCTCCTCATCCGTGCAGAA
CTTGGACAACCTGGAACTCTTCTAGGAGACGACCAAATTTACAATGTAATCGTCACTGCCCACGCCTTCG
TAATAATTTTCTTTATAGTAATACCAATCATGATCGGTGGTTTCGGAAACTGACTAGTCCCACTCATAAT
CGGCGCCCCCGACATAGCATTCCCCCGTATAAACAACATAAGCTTCTGACTACTTCCCCCATCATTTCTT
TTACTTCTAGCATCCTCCACAGTAGAAGCTGGAGCAGGAACAGGGTGAACAGTATATCCCCCTCTCGCTG
GTAACCTAGCCCATGCCGGTGCTTCAGTAGACCTAGCCATCTTCTCCCTCCACTTAGCAGGTGTTTCCTC
TATCCTAGGTGCTATTAACTTTATTACAACCGCCATCAACATAAAACCCCCAACCCTCTCCCAATACCAA
ACCCCCCTATTCGTATGATCAGTCCTTATTACCGCCGTCCTTCTCCTACTCTCTCTCCCAGTCCTCGCTG
CTGGCATTACTATACTACTAACAGACCGAAACCTAAACACTACGTTCTTTGACCCAGCTGGAGGAGGAGA
CCCAGTCCTGTACCAACACCTCTTCTGATTCTTCGGCCATCCAGAAGTCTATATCCTCATTTTAC

如果我有一个上述的 fasta 文件(每行 70 个碱基),并且我想确定位置为 210 的基本字符是什么(例如:第 210 个碱基:T),那么 unix 中的命令行是什么?非常感谢您的帮助。

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1 回答 1

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$ tr -d '\n' < mexicanus.fasta | cut -b210
T
  • 从文件中删除所有换行符
  • 打印字节 210

或者如果你想要一个范围

$ tr -d '\n' < mexicanus.fasta | cut -b210-220
TCGGCGCCCCC
于 2013-04-17T01:48:08.133 回答