0

如果我在不同的荧光通道中拍摄多张图像(在用一些抗体/标记物染色细胞后),我如何自动定量每个标记物阳性细胞的比例?有没有人在 Python 中做过这样的事情?

我已经可以使用 Fiji (ImageJ) 来计算仅包含一种染色类型的细胞,但我不能让它对包含两种染色类型的合并图像进行选择性计数。由于 Fiji 与 python 交互良好,我正在考虑编写一个脚本,查看每个仅包含一种染色类型的图像,然后获取相应图像的 xy 坐标并检查它们之间的匹配。我不确定这是否是个好主意,我想知道是否有人做过类似的事情或有更有效的方式来完成任务?

谢谢你的帮助!

4

1 回答 1

0

您可以使用 cont = cv2.findcontours 找到几乎圆形的单元格并使用 len(cont) 对它们进行计数。

于 2013-04-13T18:35:05.383 回答