1

我是使用 MPI 的初学者。这里我写了一个非常简单的程序来测试 MPI 是否可以运行。这是我的hello.c：

#include <stdio.h>
#include <mpi.h>

int main(int argc, char *argv[]) {
  int numprocs, rank, namelen;
  char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];

  MPI_Init(&argc, &argv);
  MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
  MPI_Get_processor_name(processor_name, &namelen);
  MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
  printf("Process %d on %s out of %d\n", rank, processor_name, numprocs);

  MPI_Finalize();
}

我用to node来测试，hostfile是：node1 node2

所以我有两台机器，名称为 node1 和 node2。我可以在没有密码的情况下互相 ssh。

我通过键入启动程序：mpirun -np 2 -f hostfile ./hello。

可执行文件 hello 位于两台机器的同一目录中。

然后在我运行之后，我得到一个错误：

PMPI_Barrier 中的致命错误：其他 MPI 错误，错误堆栈：PMPI_Barrier(425)............：MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD) 失败 MPIR_Barrier_impl(331)......：集体 MPIR_Barrier_impl(313) 期间失败...... .: MPIR_Barrier_intra(83)....: dequeue_and_set_error(596): 等级为 0 的通信错误 PMPI_Barrier 中的致命错误：其他 MPI 错误，错误堆栈：PMPI_Barrier(425).......: MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD ) 失败 MPIR_Barrier_impl(331)....: 集体 MPIR_Barrier_impl(313)....期间失败....: MPIR_Barrier_intra(83)....: dequeue_and_set_error(596): 等级 1 的通信错误

如果我注释掉 MPI_Barrier()，它可以正常工作。机器之间的通讯好像有问题？或者我没有正确安装openmpi？有任何想法吗？

我正在使用 Ubuntu 12.10

我得到了一些提示：这在 MPICH2 中效果不佳，如果我使用 openmpi，那么它可以工作。我只是通过 sudo apt-get install mpich2 安装了 MPICH。我错过了什么吗？mpich2的大小比openmpi小很多

4

1 回答 1

0

在 /etc/hosts 中，某些 Linux 发行版的较新版本在文件顶部添加以下类型的行：

127.0.0.1 localhost
127.0.0.1 [hostname]

这应该更改，以便主机名行包含您的实际 IP 地址。如果您不进行此更改并出现以下错误，则 MPI hydra 进程将中止：

Fatal error in PMPI_Barrier: Other MPI error, error stack:
PMPI_Barrier(425)...........: MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Barrier_impl(292)......: 
MPIR_Barrier_or_coll_fn(121): 
MPIR_Barrier_intra(83)......: 
dequeue_and_set_error(596)..: Communication error with rank 0
于 2014-06-27T22:53:30.007 回答