regex - 如何在sed中匹配没有一些字符串的行

Question

我试图打印出文件夹下每个文件的第一行（以 > 开头，因为文件是 fasta 文件），并使用 sed 提取出没有质粒和片段的那些行。

我做了ls * | xargs -I one sed -n -e '/^>.*[^fragment|plasmid].*/p' one > outfile ，但它不工作？我应该如何修改它？

Answer 1

如果该行不包含片段或质粒，我是否认为您只想打印每个文件的第一行？那就是：

awk 'FNR==1 && !/fragment|plasmid/' *

如果这不是您想要的，请使用一些具有代表性的示例输入和预期输出来更新您的问题。

Answer 2

这对你有用吗？

head -q -n 1 * | egrep -v "^>.*(fragment|plasmid).*"

Answer 3

如果我将您的要求读作以 > 开头的打印行，除非它们包含片段或质粒，那么我认为这将为您做到：

sed -ne '/^>/{/fragment/;b;/plasmid/b;p;}' one > outfile

它忽略所有不以 > 开头的行，如果找到片段或质粒，它会跳到脚本的末尾并转到下一行。