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我有一个 MPI 程序（Fortran，MPICH），我需要将它转换成一个脚本，然后启动它自己的 MPI 程序（使用mpirun）。到目前为止，我已经将 shell out ( system) 命令封装在一个if(system_num .eq. root_system_num)东西中，因此只有一个 MPI 进程运行该脚本。但是，这会导致一系列HYDU_create_process错误。

我考虑过使用MPI_Comm_spawn，但有类似“MPI 没有说明如果您启动的程序是一个 shell 脚本并且那个 shell 脚本启动一个调用的程序会发生什么”的警告MPI_INIT，所以这似乎也不理想。

几点：

  • shell脚本中调用的程序根本不需要与调用程序交互。调用程序只需要等到该过程完成。
  • 没有一种简单的方法可以将 shell 脚本转换为单独的可执行文件（大量的环境变量设置等）。
  • 理想情况下，这应该适用于 MPICH 和Open MPI。

有没有办法做到这一点？

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对于 MPICH MPI_Comm_spawn，不幸的是，您最好使用 . 您唯一的其他选择是在调用嵌套 MPI 程序之前找出所有依赖于实现、依赖于版本的环境变量，这些环境变量需要unset在您的 shell 脚本中。一些示例变量（对于 MPICH）将包括PMI_RANK和PMI_PORT：

% mpiexec -n 1 env | egrep '^PMI|^HYD'
HYDI_CONTROL_FD=8
PMI_RANK=0
PMI_FD=7
PMI_SIZE=1

显然，对于 Open MPI 或不同版本的 MPICH2/MPICH，需要调整不同的变量。

于 2013-04-11T13:03:29.743 回答