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我一直在使用这个问题的建议: Find value from one csv in another one (like vlookup) in bash (Linux)

尝试创建一个脚本,在其中遍历多个数据文件,并以 vlookup 样式的方式从其他几个(单个)参考文件中添加列。

数据文件示例 (*.data)

info1   7   44567    1   2  marker1
info2   3   143679   2   2  marker2

参考文件示例(ref.txt,要查找的文件)

marker1     66%
marker2     34%

第二个参考文件示例(ref2.txt,第二个要查找的文件)

info1 准确
info2 部分

需要输出

info1   7   44567    1   2  marker1   66%   exact
info2   3   143679   2   2  marker2   34%   partial

尝试循环(仅显示一个参考文件,因为我还没有工作!)

#!/bin/bash
for file in `ls /path/*.data`; 
do
for i in $file; 
do 
KEY=$(cut -f 6 $file);
    printf "%s\t" $i;
    grep "${KEY}" /path/ref1.txt | cut -f 2 ; 
done
done

我认为我编写的脚本有两个问题当前输出是每个输入文件一行,而不是附加的输入文件的所有行,它是文件的文件名而不是文件中的一行。不过,参考位似乎确实有效(据我所知,单行输出)。IE:

/path/1.data    66%

谁能告诉我出了什么问题,或者请提出一个更聪明的方法来做到这一点?非常感谢。

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有一个join实用程序。特别是,给定您的示例:

join -o 1.1,1.1,1.3,1.4,1.5,1.6,2.2 -1 6 -2 1 test.data ref.txt |
  join -o 1.1,1.1,1.3,1.4,1.5,1.6,1.7,2.2 -j 1 - ref2.txt

这会产生您建议的输出。该-o <list>选项指定要以格式打印的每个字段<filenumber>.<fieldnumber>-1 <n>-2 <n>指定要在每个文件中分别匹配哪个字段,并且-j <n>是当两个文件中的字段编号相同时可以使用的快捷方式。

于 2013-02-27T21:46:18.357 回答