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我正在尝试使用 MPI 实现 Cannons 算法,我正在使用以下示例代码:

http://siber.cankaya.edu.tr/ozdogan/GraduateParallelComputing.old/ceng505/node133.html

有一段看不懂。这是示例代码。

37    /* Perform the initial matrix alignment. First for A and then for B */ 
38    MPI_Cart_shift(comm_2d, 0, -mycoords[0], &shiftsource, &shiftdest); 
39    MPI_Sendrecv_replace(a, nlocal*nlocal, MPI_DOUBLE, shiftdest, 
40        1, shiftsource, 1, comm_2d, &status); 
41 
42    MPI_Cart_shift(comm_2d, 1, -mycoords[1], &shiftsource, &shiftdest); 
43    MPI_Sendrecv_replace(b, nlocal*nlocal, MPI_DOUBLE, 
44        shiftdest, 1, shiftsource, 1, comm_2d, &status); 

这是我当前的代码。

MPI_Comm_size(comm, &size); 
MPI_Comm_rank(comm, &rank); 
MPI_Cart_coords(comm, rank, 2, coordinates); 

MPI_Cart_shift(comm, 0, -1, &rightrank, &leftrank);
MPI_Cart_shift(comm, 1, -1, &downrank, &uprank); 

MPI_Cart_shift(comm, 0, -coordinates[0], &shiftsource, &shiftdest); 
printf("coordinates[0] = %d for a shiftsource = %d, shiftdest = %d\n", coordinates[0], shiftsource, shiftdest);
//MPI_Sendrecv_replace(a, a->rowNum * a->colNum, MPI_INT, shiftdest, 
    //1, shiftsource, 1, comm, &status); 

MPI_Cart_shift(comm, 1, -coordinates[1], &shiftsource, &shiftdest); 
printf("coordinates[1] = %d for b shiftsource = %d, shiftdest = %d\n", coordinates[1], shiftsource, shiftdest);
//MPI_Sendrecv_replace(b, b->rowNum * b->colNum, MPI_INT, 
  //  shiftdest, 1, shiftsource, 1, comm, &status); 

我在不同的函数中调用 MPI_Cart_create,但它与示例代码中的基本调用相同。

MPI_Comm_size (MPI_COMM_WORLD, &size);  /* get number of processes */
    .
    .
    .
if(is_perfect_square(size))  dim_size[0] = dim_size[1] = (int) sqrt(size);
else
{ //if size = 2 then dims = 2, 1; size = 4 then 2,2; 8 = 4, 2...
    dim_size[0] = (int) sqrt(size + size);
    dim_size[1] = dim_size[0] / 2;
}
MPI_Cart_create(MPI_COMM_WORLD, 2, dim_size, periods, 1, &CannonsCart);

现在我只是想了解 shiftsource 和 shiftdest 的意义。我假设它是用于初始转变,但是当我运行此代码时,我的 printf 语句会这样说。

coordinates[0] = 0 for a shiftsource = 0, shiftdest = 0
coordinates[1] = 0 for b shiftsource = 0, shiftdest = 0

coordinates[0] = 1 for a shiftsource = 1, shiftdest = 1
coordinates[1] = 1 for b shiftsource = 2, shiftdest = 2

coordinates[0] = 1 for a shiftsource = 0, shiftdest = 0
coordinates[1] = 0 for b shiftsource = 2, shiftdest = 2

coordinates[0] = 0 for a shiftsource = 1, shiftdest = 1
coordinates[1] = 1 for b shiftsource = 0, shiftdest = 0

我不明白为什么 shiftsource 和 shiftdest 是一样的。对于矩阵 a 和 b,它应该是左边一个,一个向上。

对于这个测试用例,这个调用的进程数(IE 大小)是 4。如果需要,我将托管我的所有代码。

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第三个参数MPI_Cart_shift是沿第二个参数指定的维度(方向)的位移。0对于沿指定维度具有坐标的所有进程,位移也将是0(因为它被指定为-coordinate[i]),因此源和目标等级将匹配调用进程的等级。

当位移是因为您的拓扑是 2x2shiftsource并且您在两个维度上都有周期性边界条件时,您也会得到相同的结果。沿先前等级的选定维度的坐标将是(这里计算模数)。但这等于,正好是下一个等级的坐标。因此,前一个过程和下一个过程的坐标重合,因此排名最终相同。shiftdest1(coordinates[i] - 1 + 2) % 2(a - m + k) % ka - mk(coordinate[i] + 1) % 2

于 2013-02-22T12:11:12.737 回答