r - 计算测试特性

Question

我有一个来自更大数据集的 2x2 列联表：

> ct
        disease
    test   0   1
     no  118  12
     yes  24  46

我想快速检索不同的（医学）诊断测试特征，例如

• 灵敏度
• 特异性
• 似然比 +
• 似然比 -
• 误报率
• 假阴性率
• 疾病概率
• 预测值为正
• 预测值负
• p（否定测试错误）
• p（测试阳性）
• p（测试阴性）
• 整体准确度

与它们各自的 95% CI。是否有一个包/功能可以做到这一点？非常感谢。

Answer 1

您可能可以为这些测试特征中的每一个编写自定义函数。它将确保您的特定问题的正确格式，并且可能比您已经在做的所有谷歌搜索更快。每一个都应该很快。例如，灵敏度：

sens <- function(ct) { ct[2,2] / sum(ct[,2]) }

和特异性：

spec <- function(ct) { ct[1,1] / sum(ct[,1]) }

Answer 2

好的，epi.tests(t, verbose=T)是的。